RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.53
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SH3BP2-221ENST00000511747 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF440Q8IYI8 595 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-221ENST00000511747 MSANTD3Q96H12 275 aa24.62■■□□□ 1.53
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SH3BP2-221ENST00000511747 DNM1P46Q6ZS02 220 aa24.6■■□□□ 1.53
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SH3BP2-221ENST00000511747 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM106AQ96A25 262 aa24.6■■□□□ 1.53
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SH3BP2-221ENST00000511747 COL4A2P08572 1712 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-221ENST00000511747 OR4C45A6NMZ5 311 aa24.59■■□□□ 1.53
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SH3BP2-221ENST00000511747 C1orf61Q13536 156 aa24.59■■□□□ 1.53
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SH3BP2-221ENST00000511747 DPY19L4Q7Z388 723 aa24.59■■□□□ 1.53
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SH3BP2-221ENST00000511747 SIX5Q8N196 739 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2G2Q8NGZ5 317 aa24.59■■□□□ 1.53
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SH3BP2-221ENST00000511747 OR2A7Q96R45 310 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-221ENST00000511747 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
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SH3BP2-221ENST00000511747 ODF4Q2M2E3 257 aa24.59■■□□□ 1.53
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF524Q96C55 264 aa24.59■■□□□ 1.53
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SH3BP2-221ENST00000511747 UBQLN4Q9NRR5 601 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-221ENST00000511747 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa24.58■■□□□ 1.53
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF676Q8N7Q3 588 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-221ENST00000511747 OR8K3Q8NH51 312 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-221ENST00000511747 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
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SH3BP2-221ENST00000511747 RBBP9O75884 186 aa24.58■■□□□ 1.52
SH3BP2-221ENST00000511747 ATXN8OSP0DMR3 200 aa24.58■■□□□ 1.52
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