RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 AKR7A3O95154 331 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 RENP00797 406 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 VEGFCP49767 419 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 TMPRSS12Q86WS5 348 aa15.37■□□□□ 0.05
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ACTB-207ENST00000462494 ULBP3Q9BZM4 244 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 CUTCQ9NTM9 273 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
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ACTB-207ENST00000462494 ECDO95905 644 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
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ACTB-207ENST00000462494 CXCR1P25024 350 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
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ACTB-207ENST00000462494 PM20D2Q8IYS1 436 aa15.37■□□□□ 0.05
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ACTB-207ENST00000462494 FOXN4Q96NZ1 517 aa15.37■□□□□ 0.05
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ACTB-207ENST00000462494 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
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ACTB-207ENST00000462494 ART1P52961 327 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 PER3P56645 1201 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 AP3S2P59780 193 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 C1QL3Q5VWW1 255 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 FGD2Q7Z6J4 655 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 MARCH3Q86UD3 253 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 TSTD1Q8NFU3 115 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 OR51A4Q8NGJ6 313 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 OR10AC1Q8NH08 325 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15.36■□□□□ 0.05
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ACTB-207ENST00000462494 RABL2BQ9UNT1 228 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 MEIKINA0A087WXM9 373 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 FRG2CA6NGY1 282 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 LILRA5A6NI73 299 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 TOXO94900 526 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 ABHD16AO95870 558 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 TXNDC12O95881 172 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 PLGP00747 810 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
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ACTB-207ENST00000462494 NME1P15531 152 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 ZBTB37Q5TC79 503 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 KLHL15Q96M94 604 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 COMMD4Q9H0A8 199 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 TAS2R10Q9NYW0 307 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
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ACTB-207ENST00000462494 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
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ACTB-207ENST00000462494 DNASE1P24855 282 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 CD38P28907 300 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 SSTR2P30874 369 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 P2RX1P51575 399 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 ZP1P60852 638 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 EMC4Q5J8M3 183 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 OR2G2Q8NGZ5 317 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 RAB40AQ8WXH6 277 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 TMEM106AQ96A25 262 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 INTS14Q96SY0 518 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 LAT2Q9GZY6 243 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 DLL4Q9NR61 685 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 CACNA1CQ13936 2221 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 A0A1B0GVI7 797 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 FITM1A5D6W6 292 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 H0YC42 278 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-207ENST00000462494 DCTDP32321 178 aa15.35■□□□□ 0.05
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