RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 MTFR2Q6P444 385 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 LUZP2Q86TE4 346 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 MS4A3Q96HJ5 214 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHDC3Q9BQ90 382 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 RXFP3Q9NSD7 469 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 TECTAO75443 2155 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 MEIKINA0A087WXM9 373 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GVI7 797 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 LILRA5A6NI73 299 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 PDCD5O14737 125 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 OIP5O43482 229 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CD14P08571 375 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 PNMTP11086 282 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 DPP4P27487 766 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GRPRP30550 384 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GDNFP39905 211 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGEB1P43366 347 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CD226Q15762 336 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 HES5Q5TA89 166 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF511Q8NB15 262 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 PIGKQ92643 395 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 MOGAT1Q96PD6 335 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A18Q9H1K4 315 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SMOC1Q9H4F8 434 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 PRODH2Q9UF12 536 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 APEHP13798 732 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 MED25Q71SY5 747 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 FGD2Q7Z6J4 655 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC28AQ8IWP9 274 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 OR56B4Q8NH76 319 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 MARVELD3Q96A59 401 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A38Q96DW6 304 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 TSSK2Q96PF2 358 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHA1Q9HB21 404 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CUTCQ9NTM9 273 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 AUP1Q9Y679 476 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPINI2O75830 405 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SYPP08247 313 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SKP2Q13309 424 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC16A9Q7RTY1 509 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GIMAP1Q8WWP7 306 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CLDN23Q96B33 292 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZDHHC12Q96GR4 267 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP6Q96JE9 813 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GAL3ST4Q96RP7 486 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 UBQLN4Q9NRR5 601 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM127O75204 238 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GALNSP34059 522 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 COL28A1Q2UY09 1125 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC6A19Q695T7 634 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GUSBP11Q6P575 273 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CDH24Q86UP0 819 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF527Q8NB42 609 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 MMP25Q9NPA2 562 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 NANSQ9NR45 359 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 MED12Q93074 2177 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A087WV48 116 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 C17orf105B2RV13 164 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ICMTO60725 284 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CFIP05156 583 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 EGR4Q05215 589 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CBLN3Q6UW01 205 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 JAZF1Q86VZ6 243 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 DNASE2BQ8WZ79 361 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC74AQ96AQ1 378 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 DLL4Q9NR61 685 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 MOKQ9UQ07 419 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC6A5Q9Y345 797 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ASAH2BP0C7U1 165 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SDHAP31040 664 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CTXN1P60606 82 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 APOOLQ6UXV4 268 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 BEST4Q8NFU0 473 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF524Q96C55 264 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GMEB2Q9UKD1 530 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 NPTNQ9Y639 398 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 V9GY05 133 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-201ENST00000357436 SHOXO15266 292 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 UPK3AO75631 287 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 UBL4AP11441 157 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 MST1P26927 711 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 LTBQ06643 244 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 SERTAD2Q14140 314 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 ALG10Q5BKT4 473 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 OGFOD3Q6PK18 319 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 FCRLAQ7L513 359 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 LINGO2Q7L985 606 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 C10orf53Q8N6V4 93 aa17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms