RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM118AQ9NWS6 357 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF226Q9NYT6 803 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TVP23BQ9NYZ1 205 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TINAGQ9UJW2 476 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF229Q9UJW7 825 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM5Q9Y2B1 443 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 POFUT2Q9Y2G5 429 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GVC2 190 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 AQP7P3A6NL99 342 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF716A6NP11 495 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZAR1LA6NP61 321 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 BHLHE40O14503 412 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 BCKDKO14874 412 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 HCN1O60741 890 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SEC14L2O76054 403 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFB2O95178 105 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 OR6A2O95222 327 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SYNGR4O95473 234 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PMS2P2O95744 297 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 MT-ATP6P00846 226 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV3-9P01782 118 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST1H2ABP04908 130 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GYPBP06028 91 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 STSP08842 583 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 IFNGR1P15260 489 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ABOP16442 354 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GSTM3P21266 225 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FMO3P31513 532 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 UQCRFS1P47985 274 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 NUDT6P53370 316 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RAD23AP54725 363 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 BIDP55957 195 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC35A1P78382 337 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FMODQ06828 376 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXF2Q12947 444 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CAMK2DQ13557 499 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PGGHGQ32M88 737 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 MESTQ5EB52 335 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 WLSQ5T9L3 541 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SLX4IPQ5VYV7 408 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM225Q6GV28 225 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FCRLAQ7L513 359 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TUSC5Q8IXB3 177 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 DHRSXQ8N5I4 330 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PACRGLQ8N7B6 248 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TCEANCQ8N8B7 351 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZIC4Q8N9L1 334 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SDR9C7Q8NEX9 313 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 BBS1Q8NFJ9 593 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 OR52E2Q8NGJ4 325 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 OR51L1Q8NGJ5 315 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM81AQ8TBF8 368 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM57AQ8TBR7 257 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNRF4Q8WWF5 429 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SGCDQ92629 289 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST1H2ACQ93077 130 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 OTULINQ96BN8 352 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SARAFQ96BY9 339 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CNBD2Q96M20 576 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 MUS81Q96NY9 551 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TSSK2Q96PF2 358 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SLX1AQ9BQ83 275 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PRRG4Q9BZD6 226 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC19A3Q9BZV2 496 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RERGLQ9H628 205 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 C12orf49Q9H741 205 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CALHM2Q9HA72 323 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 INIPQ9NRY2 104 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF6Q9Y252 685 aa5.36□□□□□ -1.55
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