RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 A0A075B6Q4 140 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 C2orf72A6NCS6 295 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 IL1AP01583 271 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 F13BP05160 661 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 GYPBP06028 91 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CELA2AP08217 269 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 OTX2P32243 289 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TGFBR1P36897 503 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CD79BP40259 229 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 BLVRAP53004 296 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZNF85Q03923 595 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 FOXF1Q12946 379 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 HES3Q5TGS1 186 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 KLBQ86Z14 1044 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TMEM156Q8N614 296 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 KCTD7Q96MP8 289 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 XKRYO14609 159 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TERTO14746 1132 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 RNF13O43567 381 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SNX4O95219 450 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 LALBAP00709 142 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CD1AP06126 327 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 OPRL1P41146 370 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 MESTQ5EB52 335 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 DHRS13Q6UX07 377 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 IP6K3Q96PC2 410 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ALG12Q9BV10 488 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 HPF1Q9NWY4 346 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ALKBH4Q9NXW9 302 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 POLHQ9Y253 713 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 VDAC3Q9Y277 283 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 A0A1W2PRG6 482 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 A6NIZ1 184 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 PLPP2O43688 288 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 WISP1O95388 367 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CELP19835 753 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 RORCP51449 518 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 RAP1BP61224 184 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 RAP1AP62834 184 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CDONQ4KMG0 1287 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SLC6A19Q695T7 634 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 RAB43Q86YS6 212 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZNF519Q8TB69 540 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 POC1BQ8TC44 478 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 NXPE2Q96DL1 559 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 NCDNQ9UBB6 729 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 FKBP7Q9Y680 259 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 DMDP11532 3685 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 LIPT2A6NK58 231 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SNPHO15079 494 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SEC14L5O43304 696 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TFP02787 698 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 F8A1P23610 371 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CD82P27701 267 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 PUDPQ08623 228 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms