RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 MEIOCA2RUB1 952 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ABLIM3O94929 683 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GCAP28676 217 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HLA-FP30511 346 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ETV1P50549 477 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SIRPAP78324 504 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SELPLGQ14242 412 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DUSP6Q16828 381 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ALG12Q9BV10 488 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MMP28Q9H239 520 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 K7EPK0 472 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SIGLEC6O43699 453 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DBHP09172 617 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CALCBP10092 127 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CDK4P11802 303 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ELK1P19419 428 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC1A3P43003 542 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CCR5P51681 352 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CARD18P57730 90 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HBA1P69905 142 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC14A1Q13336 389 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 AARDQ4LEZ3 155 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF534Q76KX8 674 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PRR18Q8N4B5 295 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RNF175Q8N4F7 328 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DTX3Q8N9I9 347 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ASB13Q8WXK3 278 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GLCEO94923 617 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CAPNS1P04632 268 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CHRM4P08173 479 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CTXN2P0C2S0 81 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 T-ENOLP0DO92 83 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DRD5P21918 477 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 BCKDHBP21953 392 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HOXD12P35452 270 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CXADRP78310 365 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF266Q14584 549 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SAXO2Q658L1 398 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 EDAQ92838 391 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLC35A4Q96G79 324 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TSPAN11A1L157 253 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 F6UZH7 168 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 K7EQM0 130 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PAPLNO95428 1278 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PMS2P2O95744 297 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 THBS1P07996 1170 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF728P0DKX0 622 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MTHFD2P13995 350 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GLULP15104 373 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PTGER4P35408 488 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GJA5P36382 358 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SERPINF1P36955 418 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GABRA2P47869 451 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GABREP78334 506 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DYRK1AQ13627 763 aa6.68□□□□□ -1.34
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CPS1-201ENST00000233072 ZNF74Q16587 644 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 AFMIDQ63HM1 303 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CGB2Q6NT52 195 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DOK3Q7L591 496 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KDM8Q8N371 416 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DOK4Q8TEW6 326 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RNF170Q96K19 258 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LYSMD1Q96S90 227 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 NOX4Q9NPH5 578 aa6.68□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CD300AQ9UGN4 299 aa6.68□□□□□ -1.34
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