RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psma8Q9CWH6 250 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem219Q9D123 240 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam45aQ9D8N2 357 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Calr3Q9D9Q6 380 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem38bQ9DAV9 292 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DhdhQ9DBB8 333 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr938Q9EQ93 315 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cryba2Q9JJV1 197 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alyref2Q9JJW6 218 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cnot9Q9JKY0 299 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sfrp5Q9WU66 314 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp68Q9Z116 606 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp6v1c1Q9Z1G3 382 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Muc4Q8JZM8 3443 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr228A0A1L1SR98 313 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep85lA0A1W2P884 806 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ggta1l1A2AUQ7 319 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc24E9PUW8 296 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr549E9Q542 316 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp938E9Q9G3 579 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zmat3O54836 290 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TpmtO55060 240 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gtf2h4O70422 463 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf271P15620 580 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gsta3P30115 221 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Guca2aP33680 116 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rac3P60764 192 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fmo5P97872 533 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cxcr5Q04683 374 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CbfbQ08024 187 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Yy2Q3TTC2 378 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gramd2aQ3V3G7 320 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nr2f1Q60632 422 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpank1Q61858 372 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mea1Q64327 174 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Iqcf4Q6P8Y2 204 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc6a7Q6PGE7 637 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp954Q7TNU5 416 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PigvQ7TPN3 493 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr885Q7TRE0 309 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr290Q7TS13 315 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc6a15Q8BG16 729 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NelfaQ8BG30 530 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Flrt3Q8BGT1 649 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TiprlQ8BH58 271 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 QpctlQ8BH73 383 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mfsd11Q8BJ51 449 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fndc9Q8BJN4 226 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ckap4Q8BMK4 575 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lcmt2Q8BYR1 686 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prkd2Q8BZ03 875 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Asrgl1Q8C0M9 326 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrn3Q8CBC6 707 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc28bQ8CEG5 200 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8CF31 99 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Thoc1Q8R3N6 657 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cbx7Q8VDS3 158 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhbdd2Q8VEK2 361 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr109Q8VG96 314 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr870Q8VGG4 311 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CytipQ91VY6 359 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc39a8Q91W10 462 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnps1Q99M28 305 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9CQT6 229 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arpc2Q9CVB6 300 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdca4Q9CWM2 237 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 9230112D13RikQ9D260 137 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spaca7Q9D2S4 182 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TcimQ9D915 106 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr961Q9EQ84 314 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gal3st1Q9JHE4 423 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr545Q9WU94 316 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abca1P41233 2261 aa9.91□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CadB2RQC6 2225 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr239A0PK55 315 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp937A2ANU7 503 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp945E9PYM8 794 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8922F6XVS9 199 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr55K7N6Q1 315 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdh12O55134 1180 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01735 133 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Anxa2P07356 339 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hoxb2P0C1T1 354 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd3gP11942 182 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Evx1P23683 416 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adamts15P59384 950 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q0VG62 139 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem88bQ3TYP4 173 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cmpk2Q3U5Q7 447 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B3gnt6Q3USF0 391 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spin1Q61142 262 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc35f4Q8BZK4 485 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdc42ep2Q8JZX9 214 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sco2Q8VCL2 255 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec14aQ8VCP9 459 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr461Q8VF30 313 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr502Q8VG09 314 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fig4Q91WF7 907 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34 ms