Protein–RNA interactions for Protein: Q91VY6

Cytip, Cytohesin-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CytipQ91VY6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CytipQ91VY6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CytipQ91VY6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CytipQ91VY6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CytipQ91VY6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CytipQ91VY6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CytipQ91VY6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CytipQ91VY6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CytipQ91VY6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CytipQ91VY6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CytipQ91VY6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CytipQ91VY6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CytipQ91VY6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CytipQ91VY6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CytipQ91VY6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CytipQ91VY6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CytipQ91VY6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CytipQ91VY6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CytipQ91VY6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CytipQ91VY6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CytipQ91VY6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CytipQ91VY6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CytipQ91VY6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CytipQ91VY6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CytipQ91VY6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CytipQ91VY6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CytipQ91VY6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CytipQ91VY6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CytipQ91VY6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CytipQ91VY6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CytipQ91VY6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CytipQ91VY6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CytipQ91VY6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CytipQ91VY6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CytipQ91VY6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CytipQ91VY6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CytipQ91VY6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CytipQ91VY6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CytipQ91VY6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CytipQ91VY6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CytipQ91VY6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CytipQ91VY6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CytipQ91VY6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CytipQ91VY6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CytipQ91VY6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CytipQ91VY6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CytipQ91VY6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CytipQ91VY6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CytipQ91VY6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CytipQ91VY6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CytipQ91VY6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CytipQ91VY6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CytipQ91VY6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CytipQ91VY6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CytipQ91VY6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CytipQ91VY6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CytipQ91VY6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CytipQ91VY6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CytipQ91VY6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CytipQ91VY6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CytipQ91VY6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CytipQ91VY6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CytipQ91VY6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CytipQ91VY6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CytipQ91VY6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CytipQ91VY6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CytipQ91VY6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CytipQ91VY6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CytipQ91VY6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CytipQ91VY6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CytipQ91VY6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CytipQ91VY6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CytipQ91VY6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CytipQ91VY6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CytipQ91VY6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CytipQ91VY6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CytipQ91VY6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CytipQ91VY6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CytipQ91VY6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CytipQ91VY6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CytipQ91VY6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CytipQ91VY6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CytipQ91VY6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CytipQ91VY6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CytipQ91VY6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CytipQ91VY6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CytipQ91VY6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CytipQ91VY6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CytipQ91VY6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CytipQ91VY6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CytipQ91VY6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CytipQ91VY6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CytipQ91VY6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CytipQ91VY6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CytipQ91VY6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CytipQ91VY6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CytipQ91VY6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CytipQ91VY6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CytipQ91VY6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CytipQ91VY6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms