Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV1

Cryba2, Beta-crystallin A2, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cryba2Q9JJV1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,43■■■□□ 2,94
Cryba2Q9JJV1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Cryba2Q9JJV1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Cryba2Q9JJV1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Cryba2Q9JJV1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Cryba2Q9JJV1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cryba2Q9JJV1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Cryba2Q9JJV1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,87■■■□□ 2,21
Cryba2Q9JJV1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
Cryba2Q9JJV1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Cryba2Q9JJV1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Cryba2Q9JJV1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cryba2Q9JJV1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cryba2Q9JJV1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cryba2Q9JJV1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Cryba2Q9JJV1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Cryba2Q9JJV1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Cryba2Q9JJV1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
Cryba2Q9JJV1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Cryba2Q9JJV1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Cryba2Q9JJV1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Cryba2Q9JJV1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Cryba2Q9JJV1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Cryba2Q9JJV1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Cryba2Q9JJV1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cryba2Q9JJV1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Cryba2Q9JJV1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Cryba2Q9JJV1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Cryba2Q9JJV1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cryba2Q9JJV1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cryba2Q9JJV1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Cryba2Q9JJV1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Cryba2Q9JJV1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Cryba2Q9JJV1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Cryba2Q9JJV1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Cryba2Q9JJV1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Cryba2Q9JJV1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Cryba2Q9JJV1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Cryba2Q9JJV1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Cryba2Q9JJV1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Cryba2Q9JJV1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Cryba2Q9JJV1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Cryba2Q9JJV1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Cryba2Q9JJV1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Cryba2Q9JJV1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Cryba2Q9JJV1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Cryba2Q9JJV1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Cryba2Q9JJV1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Cryba2Q9JJV1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Cryba2Q9JJV1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Cryba2Q9JJV1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Cryba2Q9JJV1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Cryba2Q9JJV1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Cryba2Q9JJV1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cryba2Q9JJV1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Cryba2Q9JJV1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Cryba2Q9JJV1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
Cryba2Q9JJV1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Cryba2Q9JJV1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Cryba2Q9JJV1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cryba2Q9JJV1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Cryba2Q9JJV1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,63■■□□□ 1,69
Cryba2Q9JJV1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Cryba2Q9JJV1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Cryba2Q9JJV1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Cryba2Q9JJV1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Cryba2Q9JJV1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Cryba2Q9JJV1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Cryba2Q9JJV1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Cryba2Q9JJV1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Cryba2Q9JJV1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Cryba2Q9JJV1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Cryba2Q9JJV1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Cryba2Q9JJV1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Cryba2Q9JJV1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Cryba2Q9JJV1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Cryba2Q9JJV1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Cryba2Q9JJV1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Cryba2Q9JJV1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Cryba2Q9JJV1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Cryba2Q9JJV1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cryba2Q9JJV1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Cryba2Q9JJV1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Cryba2Q9JJV1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Cryba2Q9JJV1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Cryba2Q9JJV1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cryba2Q9JJV1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cryba2Q9JJV1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Cryba2Q9JJV1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Cryba2Q9JJV1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,08■■□□□ 1,61
Cryba2Q9JJV1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Cryba2Q9JJV1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cryba2Q9JJV1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Cryba2Q9JJV1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Cryba2Q9JJV1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Cryba2Q9JJV1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Cryba2Q9JJV1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Cryba2Q9JJV1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Cryba2Q9JJV1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Cryba2Q9JJV1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,9 ms