Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Hoxb2P0C1T1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hoxb2P0C1T1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Hoxb2P0C1T1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hoxb2P0C1T1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxb2P0C1T1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxb2P0C1T1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hoxb2P0C1T1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Hoxb2P0C1T1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxb2P0C1T1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxb2P0C1T1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxb2P0C1T1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxb2P0C1T1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxb2P0C1T1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxb2P0C1T1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxb2P0C1T1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxb2P0C1T1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxb2P0C1T1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxb2P0C1T1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxb2P0C1T1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxb2P0C1T1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxb2P0C1T1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxb2P0C1T1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxb2P0C1T1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxb2P0C1T1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxb2P0C1T1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxb2P0C1T1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxb2P0C1T1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxb2P0C1T1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxb2P0C1T1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb2P0C1T1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxb2P0C1T1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxb2P0C1T1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxb2P0C1T1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxb2P0C1T1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxb2P0C1T1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxb2P0C1T1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxb2P0C1T1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxb2P0C1T1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxb2P0C1T1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxb2P0C1T1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxb2P0C1T1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxb2P0C1T1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxb2P0C1T1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxb2P0C1T1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxb2P0C1T1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxb2P0C1T1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxb2P0C1T1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxb2P0C1T1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxb2P0C1T1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxb2P0C1T1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxb2P0C1T1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxb2P0C1T1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb2P0C1T1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb2P0C1T1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb2P0C1T1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb2P0C1T1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb2P0C1T1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb2P0C1T1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb2P0C1T1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb2P0C1T1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb2P0C1T1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxb2P0C1T1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb2P0C1T1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxb2P0C1T1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxb2P0C1T1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxb2P0C1T1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxb2P0C1T1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxb2P0C1T1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxb2P0C1T1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxb2P0C1T1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb2P0C1T1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb2P0C1T1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb2P0C1T1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb2P0C1T1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb2P0C1T1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb2P0C1T1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb2P0C1T1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxb2P0C1T1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxb2P0C1T1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxb2P0C1T1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxb2P0C1T1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxb2P0C1T1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb2P0C1T1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb2P0C1T1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb2P0C1T1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb2P0C1T1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb2P0C1T1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxb2P0C1T1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb2P0C1T1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb2P0C1T1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxb2P0C1T1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxb2P0C1T1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxb2P0C1T1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb2P0C1T1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb2P0C1T1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxb2P0C1T1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxb2P0C1T1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxb2P0C1T1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms