Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
B3gnt6Q3USF0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
B3gnt6Q3USF0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
B3gnt6Q3USF0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
B3gnt6Q3USF0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
B3gnt6Q3USF0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B3gnt6Q3USF0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
B3gnt6Q3USF0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
B3gnt6Q3USF0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
B3gnt6Q3USF0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
B3gnt6Q3USF0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
B3gnt6Q3USF0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
B3gnt6Q3USF0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
B3gnt6Q3USF0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
B3gnt6Q3USF0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
B3gnt6Q3USF0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B3gnt6Q3USF0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
B3gnt6Q3USF0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
B3gnt6Q3USF0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
B3gnt6Q3USF0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
B3gnt6Q3USF0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
B3gnt6Q3USF0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
B3gnt6Q3USF0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
B3gnt6Q3USF0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
B3gnt6Q3USF0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
B3gnt6Q3USF0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B3gnt6Q3USF0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
B3gnt6Q3USF0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
B3gnt6Q3USF0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
B3gnt6Q3USF0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
B3gnt6Q3USF0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B3gnt6Q3USF0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
B3gnt6Q3USF0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
B3gnt6Q3USF0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B3gnt6Q3USF0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B3gnt6Q3USF0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B3gnt6Q3USF0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B3gnt6Q3USF0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
B3gnt6Q3USF0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
B3gnt6Q3USF0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B3gnt6Q3USF0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
B3gnt6Q3USF0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
B3gnt6Q3USF0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
B3gnt6Q3USF0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
B3gnt6Q3USF0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
B3gnt6Q3USF0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
B3gnt6Q3USF0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
B3gnt6Q3USF0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B3gnt6Q3USF0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
B3gnt6Q3USF0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B3gnt6Q3USF0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
B3gnt6Q3USF0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
B3gnt6Q3USF0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
B3gnt6Q3USF0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B3gnt6Q3USF0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
B3gnt6Q3USF0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B3gnt6Q3USF0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B3gnt6Q3USF0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
B3gnt6Q3USF0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
B3gnt6Q3USF0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
B3gnt6Q3USF0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
B3gnt6Q3USF0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B3gnt6Q3USF0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
B3gnt6Q3USF0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
B3gnt6Q3USF0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
B3gnt6Q3USF0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
B3gnt6Q3USF0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
B3gnt6Q3USF0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
B3gnt6Q3USF0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B3gnt6Q3USF0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B3gnt6Q3USF0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
B3gnt6Q3USF0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
B3gnt6Q3USF0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B3gnt6Q3USF0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B3gnt6Q3USF0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B3gnt6Q3USF0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B3gnt6Q3USF0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B3gnt6Q3USF0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B3gnt6Q3USF0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B3gnt6Q3USF0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B3gnt6Q3USF0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B3gnt6Q3USF0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B3gnt6Q3USF0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B3gnt6Q3USF0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B3gnt6Q3USF0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B3gnt6Q3USF0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
B3gnt6Q3USF0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
B3gnt6Q3USF0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
B3gnt6Q3USF0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
B3gnt6Q3USF0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B3gnt6Q3USF0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B3gnt6Q3USF0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B3gnt6Q3USF0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B3gnt6Q3USF0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B3gnt6Q3USF0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
B3gnt6Q3USF0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B3gnt6Q3USF0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B3gnt6Q3USF0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
B3gnt6Q3USF0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B3gnt6Q3USF0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms