RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503393.6

SH3BP2-207, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-207ENST00000503393 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 C5P01031 1676 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 LRIT2A6NDA9 550 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 GABARAPH6UMI1 98 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 IMPA2O14732 288 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 ADAM23O75077 832 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 LAP3P28838 519 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 WNT7BP56706 349 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 JAG1P78504 1218 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 CCNJQ5T5M9 372 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 TSSK2Q96PF2 358 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 ECI1P42126 302 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 COX15Q7KZN9 410 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF75AQ96N20 296 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 UHRF2Q96PU4 802 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 ACOD1A6NK06 481 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 CPNE6O95741 557 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 SRMP19623 302 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 THBS3P49746 956 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 FABP6P51161 128 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 CCR9P51686 369 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 BRICD5Q6PL45 260 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 RNF212BA8MTL3 300 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 HTR2CP28335 458 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 UBXN10Q96LJ8 280 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 SCN1AP35498 2009 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 APOA2P02652 100 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 MMP2P08253 660 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 F3P13726 295 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 TNFRSF17Q02223 184 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 CST6Q15828 149 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 MAVSQ7Z434 540 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 RNF212Q495C1 297 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 VPS25Q9BRG1 176 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 JUNDP17535 347 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 SHC1P29353 583 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 HHEXQ03014 270 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 MDGA2Q7Z553 956 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 RNF32Q9H0A6 362 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 OCEL1Q9H607 264 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 SCML1Q9UN30 329 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 JMJD7P0C870 316 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 CD70P32970 193 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 OR5B2Q96R09 309 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 GPR34Q9UPC5 381 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 H3BML4 177 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 LPAR4Q99677 370 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 PPP5D1E7EU14 171 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 CLDN12P56749 244 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 OR7D2Q96RA2 312 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 PFKMP08237 780 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 FOLR1P15328 257 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 KPTNQ9Y664 436 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 TXNDC12O95881 172 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF44P15621 663 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-207ENST00000503393 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms