RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488601.6

POLR1C-208, Transcript of RNA polymerase I and III subunit C, human

TSL 2

Gene POLR1C, Length 973 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1C-208	ENST00000488601	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	RAB8B	Q92930	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	EME1	Q96AY2	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	RNF183	Q96D59	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	MCEE	Q96PE7	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	NT5M	Q9NPB1	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601		A0A096LPK6	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601		A0A1W2PR80	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CLGN	O14967	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	FZD7	O75084	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	NKX2-2	O95096	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	GUCA1C	O95843	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	HOXB5	P09067	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	OR12D1	P0DN82	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PCNA	P12004	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	GABRB1	P18505	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PSMA2	P25787	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CMPK1	P30085	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	HMGCL	P35914	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	FNTA	P49354	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CDH17	Q12864	832 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	VSTM4	Q8IW00	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	NPW	Q8N729	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601		A0A1W2PPV9	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	HSPB6	O14558	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	XRCC3	O43542	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ZIC3	O60481	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	HCK	P08631	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	COX5A	P20674	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	MIP	P30301	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	GPR12	P47775	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CDH6	P55285	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	RASA2	Q15283	850 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SGCB	Q16585	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	POC5	Q8NA72	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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