RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	NAPA	P54920	295 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MAX	P61244	160 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CFHR1	Q03591	330 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CEACAM7	Q14002	265 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	PSG5	Q15238	335 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR8G1	Q15617	311 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	RPEL1	Q2QD12	228 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZBED5	Q49AG3	693 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SFT2D3	Q587I9	215 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LPCAT4	Q643R3	524 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FAM166A	Q6J272	317 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF774	Q6NX45	483 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	DTX1	Q86Y01	620 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	STPG2	Q8N412	459 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SVOPL	Q8N434	492 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR51A7	Q8NH64	312 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	GPR151	Q8TDV0	419 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NAT14	Q8WUY8	206 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ISOC2	Q96AB3	205 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FAM136A	Q96C01	138 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TLCD1	Q96CP7	247 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SMIM12	Q96EX1	92 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SFRP2	Q96HF1	295 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MICU1	Q9BPX6	476 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MND1	Q9BWT6	205 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NANS	Q9NR45	359 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TFR2	Q9UP52	801 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SNX24	Q9Y343	169 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	KAT6A	Q92794	2004 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ASTN1	O14525	1302 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398		A0A0G2JMP0	313 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398		A0A0X1KG70	313 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FRG2C	A6NGY1	282 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TNFSF11	O14788	317 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	EFNA2	O43921	213 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CA11	O75493	328 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CSN3	P07498	182 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SCGB1A1	P11684	91 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF35	P13682	527 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ITGB7	P26010	798 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	BDKRB1	P46663	353 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	GABRA4	P48169	554 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	DNASE1L1	P49184	302 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CNTN1	Q12860	1018 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	C1orf61	Q13536	156 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	GRB14	Q14449	540 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	KIF19	Q2TAC6	998 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LIN52	Q52LA3	116 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	EMC4	Q5J8M3	183 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM42	Q69YG0	159 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	RGMB	Q6NW40	437 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LGI4	Q8N135	537 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CADM2	Q8N3J6	435 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LFNG	Q8NES3	379 aa		2.91	□□□□□ -1.94

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