RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 EML6Q6ZMW3 1958 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 MFSD4AQ8N468 514 aa16.21■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 OR2Y1Q8NGV0 311 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 SLC22A8Q8TCC7 542 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 IMMP1LQ96LU5 166 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 RASL10BQ96S79 203 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 OR11A1Q9GZK7 315 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 SLC6A5Q9Y345 797 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 NPIPB7O75200 414 aa16.21■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 CELP19835 753 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 S100ZQ8WXG8 99 aa16.21■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 BABAM2Q9NXR7 383 aa16.21■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
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ACTB-201ENST00000331789 DIO1P49895 249 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 PON3Q15166 354 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 C1orf140Q5VVS0 124 aa16.2■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 SNTG1Q9NSN8 517 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 PISDQ9UG56 409 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 FAM171A2A8MVW0 826 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 C11orf98E9PRG8 122 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 MASP2O00187 686 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 CBFA2T3O75081 653 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 SDHAP31040 664 aa16.19■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM234Q8WY98 164 aa16.19■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 VDAC3Q9Y277 283 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 A3GALT2U3KPV4 340 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa16.19■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 ST8SIA1Q92185 356 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 TSSK2Q96PF2 358 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 BARHL1Q9BZE3 327 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 GRHPRQ9UBQ7 328 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 H7C1C5 153 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 ITGA10O75578 1167 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
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