RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617022.4

DDB2-212, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene DDB2, Length 2,181 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2-212ENST00000617022 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 PLAG1Q6DJT9 500 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 GATSQ8NAP1 163 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 EPYCQ99645 322 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 IL17BQ9UHF5 180 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 KCND3Q9UK17 655 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 AKR7A2O43488 359 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 CYP7B1O75881 506 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 PTHP01270 115 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 IFI30P13284 250 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 HPGDP15428 266 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 EXT1Q16394 746 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 CCDC120Q96HB5 630 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 MYOTQ9UBF9 498 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.6□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 PCSK5Q92824 1860 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 GGT2P36268 569 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 ZNF136P52737 540 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 PSPHP78330 225 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 KLHL26Q53HC5 615 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 APOOLQ6UXV4 268 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 ATCAYQ86WG3 371 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 DTX1Q86Y01 620 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 PRRC1Q96M27 445 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 MCHR1Q99705 422 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 MMP25Q9NPA2 562 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 ING3Q9NXR8 418 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.59□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 SERINC4A6NH21 518 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 SCDO00767 359 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 OR2J2O76002 312 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 CD82P27701 267 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 PNLIPRP2P54317 469 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 TAS2R41P59536 307 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 MFSD13AQ14CX5 517 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 CD226Q15762 336 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 ZBTB37Q5TC79 503 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 TAGAPQ8N103 731 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 ZNF527Q8NB42 609 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 M1APQ8TC57 530 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.58□□□□□ -0.07
DDB2-212ENST00000617022 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.58□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 RGS5O15539 181 aa14.58□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 ADAM11O75078 769 aa14.58□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 CSTAP01040 98 aa14.58□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 LIMS1P48059 325 aa14.58□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 TAB1Q15750 504 aa14.58□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa14.58□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 MRGPREQ86SM8 312 aa14.58□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 STX19Q8N4C7 294 aa14.58□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.58□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 PPM1BO75688 479 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 STSP08842 583 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 TBXA2RP21731 343 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 HTR2AP28223 471 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 KIR2DL3P43628 341 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 RORCP51449 518 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 FBXW4P57775 412 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 FCRLBQ6BAA4 426 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 CMAHPQ9Y471 501 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 HSPB11Q9Y547 144 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 SCO1O75880 301 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 SLC22A5O76082 557 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 HMGA2P52926 109 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 RAB25P57735 213 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 Q0VFX4 171 aa14.57□□□□□ -0.08
DDB2-212ENST00000617022 MICAQ29983 383 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms