RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	OR51A7	Q8NH64	312 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	FANK1	Q8TC84	345 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	OSTF1	Q92882	214 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TAAR8	Q969N4	342 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SGCZ	Q96LD1	299 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	LHPP	Q9H008	270 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	BATF3	Q9NR55	127 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	MED17	Q9NVC6	651 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916		A0A087WXM4	84 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916		G3V3Y1	287 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SURF4	O15260	269 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	NKX2-8	O15522	239 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SUSD5	O60279	629 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	MPZL2	O60487	215 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	HCN1	O60741	890 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	FZD7	O75084	574 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	ENTPD6	O75354	484 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	NEURL1	O76050	574 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	RCBTB2	O95199	551 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SLC2A10	O95528	541 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	CLPTM1	O96005	669 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	ADRA2A	P08913	450 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	CCNA2	P20248	432 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	IL11	P20809	199 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	CXCR1	P25024	350 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	UQCRC1	P31930	480 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	GRK5	P34947	590 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	CD96	P40200	585 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SLC15A1	P46059	708 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	HTR3A	P46098	478 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SLC9A3	P48764	834 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	CD97	P48960	835 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	PCYT1A	P49585	367 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	NUDT6	P53370	316 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TUBA4A	P68366	448 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	FOXF1	Q12946	379 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	IGFBP7	Q16270	282 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	OCLN	Q16625	522 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	GXYLT1	Q4G148	440 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SYT14P1	Q58G82	188 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF773	Q6PK81	442 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	CASP12	Q6UXS9	341 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	OAF	Q86UD1	273 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM163	Q8TC26	289 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	STK35	Q8TDR2	534 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM234	Q8WY98	164 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	GGH	Q92820	318 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	AMBN	Q9NP70	447 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	DEPP	Q9NTK1	212 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	STMN3	Q9NZ72	180 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	VDAC3	Q9Y277	283 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	CACNA1C	Q13936	2221 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	MED12L	Q86YW9	2145 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SH3D21	A4FU49	640 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	PINLYP	A6NC86	204 aa		6.61	□□□□□ -1.35

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