RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000064190.12

Rai1-201, Transcript of Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rai1, Length 7,348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1-201ENSMUST00000064190 3300002I08RikQ9CXH3 147 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Sgk3Q9ERE3 496 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Spag4Q9JJF2 443 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr225E9PWF9 419 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Dnajb3O35723 242 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Etv4P28322 485 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mmp2P33434 662 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rbm45Q8BHN5 476 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr522Q8VGL1 312 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Thumpd1Q99J36 350 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gje1Q9CX92 205 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 P33monoxQ9DBN4 303 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ighv16-1A0A0A6YW39 117 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Kdf1A2A9F4 397 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 SmgcF6VRN1 385 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 IlkO55222 452 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Prkar2aP12367 401 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Lgals3P16110 264 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 RabggtbP53612 339 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 UnklQ5FWH2 727 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr782Q7TRI2 314 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr771Q8VFH6 317 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr1504Q8VFQ4 315 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 MpiQ924M7 423 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Sfxn5Q925N0 342 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Dnmt3lQ9CWR8 421 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ankrd7Q9D504 279 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 DhdhQ9DBB8 333 aa15.08■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cytl1A1E5L0 139 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 4930402F06RikA2AUQ8 332 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Klrg1O88713 188 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 B4galnt2Q09199 510 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Spem2Q8C5U4 503 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Vmn1r200Q8R281 312 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rab7bQ8VEA8 199 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tex33Q9D9J2 266 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 PolmQ9JIW4 496 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cd2P08920 344 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Nme2Q01768 152 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Q3V0E1 1183 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Acp6Q8BP40 418 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr361Q8VF16 322 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Fxyd4Q9D2W0 88 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ms4a4cQ9D3F6 226 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 SnapinQ9Z266 136 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 4933403O08RikF6UK53 379 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm43191F6YIH5 235 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 H2-Eb2Q3UUV9 287 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pop7Q9DCH2 140 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cts8Q9JI81 333 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr419E9Q0Y7 313 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Hes7Q8BKT2 225 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Spp2Q8K1I3 203 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Il36gQ8R460 164 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 GmprQ9DCZ1 345 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ptf1aQ9QX98 324 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mapk7Q9WVS8 806 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Htra4A2RT60 483 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cyb5r2Q3KNK3 276 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Lpar4Q8BLG2 370 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Il34Q8R1R4 235 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 PnckQ9QYK9 343 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 En1P09065 401 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 4930480E11RikQ0VG34 394 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 4930438A08RikQ5SPH3 536 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr3Q60879 313 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cd37Q61470 281 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tm4sf1Q64302 202 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Wnt8aQ64527 354 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Adprhl1Q8BGK2 353 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 BphlQ8R164 291 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr1241Q8VF91 314 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mrgpra7Q91ZC5 305 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr713Q920G5 324 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 PccbQ99MN9 541 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cdca4Q9CWM2 237 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Nxt1Q9QZV9 140 aa15.07■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mmp12P34960 473 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Fkbp10Q61576 581 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Sema4cQ64151 834 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Q8BHR8 331 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Slc5a8Q8BYF6 611 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gsg1Q8R1W2 324 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ubox5Q925F4 539 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rpp30O88796 268 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Muc19Q6JHY2 733 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr309Q7TS01 308 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Lair1Q8BG84 263 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rcc2Q8BK67 520 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Batf2Q8R1H8 277 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Q9D112 206 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Vmn1r52Q9EP79 309 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr716Q9EPG6 314 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 F6Y6L6 278 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 RelP15307 587 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rbp4Q00724 201 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 B430306N03RikQ6QX36 289 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Chst2Q80WV3 530 aa15.06■□□□□ 0
Rai1-201ENSMUST00000064190 Galnt6Q8C7U7 622 aa15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.7 ms