RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data9.62□□□□□ -0.87not detected
DDI1YER143W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
DDI1YER143W CUL3P53202 744 aa9.62□□□□□ -0.87
DDI1YER143W DAK1P54838 584 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
DDI1YER143W ECM7Q06200 448 aa9.62□□□□□ -0.87
DDI1YER143W YDL206WQ12424 762 aa9.62□□□□□ -0.87
DDI1YER143W PTC2P39966 464 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
DDI1YER143W SEC9P40357 651 aa9.61□□□□□ -0.87
DDI1YER143W EFM4P40516 257 aa9.61□□□□□ -0.87
DDI1YER143W YJR107WP47145 328 aa9.61□□□□□ -0.87
DDI1YER143W COS5P47187 383 aa9.61□□□□□ -0.87
DDI1YER143W ASN1P49089 572 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
DDI1YER143W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data9.61□□□□□ -0.87not detected
DDI1YER143W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
DDI1YER143W YPR078CQ06813 372 aa9.61□□□□□ -0.87
DDI1YER143W SLX4Q12098 748 aa9.61□□□□□ -0.87
DDI1YER143W OSW2Q12202 724 aa9.61□□□□□ -0.87
DDI1YER143W MTF2P10849 440 aa9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W SNA3P14359 133 aa9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W RAD57P25301 460 aa9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W CDC11P32458 415 aa9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W MMM1P41800 426 aa9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W HSH155P49955 971 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W SHE10P53075 577 aa9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W ESBP6P53918 673 aa9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W YDR090CQ03193 310 aa9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W TRS130Q03660 1102 aa9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W ESC2Q06340 456 aa9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W ISU2Q12056 156 aa9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W HFI1Q12060 488 aa9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W HIF1Q12373 385 aa9.6□□□□□ -0.87
DDI1YER143W COX4P04037 155 aa9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W TOM70P07213 617 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W SWI6P09959 803 aa9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W SCJ1P25303 377 aa9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W SMC1P32908 1225 aa9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W STO1P34160 861 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W VID24P38263 362 aa9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W JJJ3P47138 172 aa9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W ULP1Q02724 621 aa9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W CDC73Q06697 393 aa9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W YOR131CQ12486 218 aa9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W YOL098CQ12496 1037 aa9.59□□□□□ -0.87
DDI1YER143W LAA1P39526 2014 aa9.58□□□□□ -0.88
DDI1YER143W TRP2P00899 507 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
DDI1YER143W CDC42P19073 191 aa9.58□□□□□ -0.88
DDI1YER143W AFT1P22149 690 aa9.58□□□□□ -0.88
DDI1YER143W KIP1P28742 1111 aa9.58□□□□□ -0.88
DDI1YER143W HXT1P32465 570 aa9.58□□□□□ -0.88
DDI1YER143W NIP100P33420 868 aa9.58□□□□□ -0.88
DDI1YER143W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data9.58□□□□□ -0.88not detected
DDI1YER143W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
DDI1YER143W VPS70P47161 811 aa9.58□□□□□ -0.88
DDI1YER143W BOP3P53958 396 aa9.58□□□□□ -0.88
DDI1YER143W PPM1Q04081 328 aa9.58□□□□□ -0.88
DDI1YER143W RTP1Q12751 981 aa9.58□□□□□ -0.88
DDI1YER143W IME1P21190 360 aa9.57□□□□□ -0.88
DDI1YER143W MSS51P32335 436 aa9.57□□□□□ -0.88
DDI1YER143W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
DDI1YER143W MRX3P38172 270 aa9.57□□□□□ -0.88
DDI1YER143W SET5P38890 526 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
DDI1YER143W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
DDI1YER143W REF2P42073 533 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
DDI1YER143W SIL1Q08199 421 aa9.57□□□□□ -0.88
DDI1YER143W ZPS1Q12512 249 aa9.57□□□□□ -0.88
DDI1YER143W WHI2P12611 486 aa9.56□□□□□ -0.88
DDI1YER143W MMS4P38257 691 aa9.56□□□□□ -0.88
DDI1YER143W APT1P49435 187 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
DDI1YER143W TPO2P53283 614 aa9.56□□□□□ -0.88
DDI1YER143W GIS3Q12418 502 aa9.56□□□□□ -0.88
DDI1YER143W VPS13Q07878 3144 aa9.56□□□□□ -0.88
DDI1YER143W PET123P17558 318 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W SWI3P32591 825 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W DUR3P33413 735 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W KIC1P38692 1080 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W FTR1P40088 404 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W HXT8P40886 569 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data9.55□□□□□ -0.88not detected
DDI1YER143W DAS1P47005 663 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W SMC3P47037 1230 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W CPR7P47103 393 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W CLA4P48562 842 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W NGL3Q03210 505 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W SOV1Q04748 898 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W DAS2Q12084 232 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W MCM16Q12262 181 aa9.55□□□□□ -0.88
DDI1YER143W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
DDI1YER143W RPL4AP10664 362 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
DDI1YER143W NAT1P12945 854 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
DDI1YER143W GLN3P18494 730 aa9.54□□□□□ -0.88
DDI1YER143W JNM1P36224 373 aa9.54□□□□□ -0.88
DDI1YER143W TCD1P38756 429 aa9.54□□□□□ -0.88
DDI1YER143W CAJ1P39101 391 aa9.54□□□□□ -0.88
DDI1YER143W RPL4BP49626 362 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
DDI1YER143W VPS62P53285 467 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.9 ms