RNA–Protein interactions for RNA: YER119C

AVT6, Transcript of Vacuolar aspartate and glutamate exporter, yeast

Gene AVT6, Length 1,347 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVT6	YER119C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	TRS130	Q03660	1102 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	ATG11	Q12527	1178 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	CDC42	P19073	191 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	SCJ1	P25303	377 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	BCS1	P32839	456 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	MRX3	P38172	270 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	SKP2	P42843	763 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	DAS1	P47005	663 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	NCS6	P53088	359 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	PPM1	Q04081	328 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	YLR001C	Q07895	862 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	WHI2	P12611	486 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	KIC1	P38692	1080 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	AIM21	P40563	679 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	CPR7	P47103	393 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	CLA4	P48562	842 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	RGA2	Q06407	1009 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	ERG11	P10614	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	MSS51	P32335	436 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	CDC11	P32458	415 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	YJR107W	P47145	328 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	TBF1	Q02457	562 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	SUT2	Q12286	268 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	IME1	P21190	360 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	CSG2	P35206	410 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	BLI1	P35727	113 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	BYE1	P36106	594 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	SMF1	P38925	575 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	PSF2	P40359	213 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	SGM1	P47166	707 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	KAP114	P53067	1004 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	YMR018W	Q04364	514 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	RTP1	Q12751	981 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	TOM1	Q03280	3268 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	DAL2	P25335	343 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	YKL050C	P35736	922 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	BCH2	P36122	765 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	EXO5	P38289	585 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	PSY2	P40164	858 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	YTA12	P40341	825 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	SAD1	P43589	448 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	SHS1	Q07657	551 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	OSH2	Q12451	1283 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	ZPS1	Q12512	249 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	CNS1	P33313	385 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	RCK2	P38623	610 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	DYS1	P38791	387 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	PHO86	P46956	311 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	TPO2	P53283	614 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	COX4	P04037	155 aa		11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	GLN3	P18494	730 aa		11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	TRM2	P33753	639 aa		11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	AFG3	P39925	761 aa		11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	MAD1	P40957	749 aa		11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	ISM1	P48526	1002 aa		11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	JJJ1	P53863	590 aa		11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	ERV41	Q04651	352 aa		11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	RPO26	P20435	155 aa		11.05	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	CBF2	P32504	956 aa		11.05	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	DUR3	P33413	735 aa		11.05	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	YAP1801	P38856	637 aa		11.05	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	SPC72	P39723	622 aa		11.05	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
AVT6	YER119C	ATG23	Q06671	453 aa		11.05	□□□□□ -0.64

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