RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	ADGRB1	O14514	1584 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	MNS1	Q8NEH6	495 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	TBX22	Q9Y458	520 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	PTPRM	P28827	1452 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	CHGB	P05060	677 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP7B	P35670	1465 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1B0GVL5	298 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	NR1I2	O75469	434 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	USP6	P35125	1406 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	TMC6	Q7Z403	805 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	MED14	O60244	1454 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	NEO1	Q92859	1461 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	SKIL	P12757	684 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	ARHGEF10	O15013	1369 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	ERICH4	A6NGS2	130 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	ALK	Q9UM73	1620 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP10D	Q9P241	1426 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	MYOM1	P52179	1685 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	RGS12	O14924	1447 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	A1BG	P04217	495 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	CPS1	P31327	1500 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	ERICH2	A1L162	156 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF213	O14771	459 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	GCKR	Q14397	625 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	SASH1	O94885	1247 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21	8e-6	■■■■□ 19.7
SPIN3-223	ENST00000639525	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	STX1A	Q16623	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-223	ENST00000639525	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.72	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms