RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559359.1

PSME2-208, Transcript of proteasome activator subunit 2, human

TSL 2

Gene PSME2, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME2-208	ENST00000559359	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	SCN7A	Q01118	1682 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	NBR1	Q14596	966 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	RIPK4	P57078	832 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	SETDB2	Q96T68	719 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359		H0YIN7	160 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	NPHP1	O15259	732 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	RASSF7	Q02833	373 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	TTLL6	Q8N841	843 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	CNBD1	Q8NA66	436 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME2-208	ENST00000559359	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	COL9A1	P20849	921 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	HLF	Q16534	295 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	RNF181	Q9P0P0	153 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	MYL6B	P14649	208 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	PDE6B	P35913	854 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	ST5	P78524	1137 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	MAP3K7	O43318	606 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	PRELP	P51888	382 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	C21orf2	O43822	256 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	ANXA1	P04083	346 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	NECTIN2	Q92692	538 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	NFKBIE	O00221	500 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	GPT	P24298	496 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	PROX2	Q3B8N5	592 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME2-208	ENST00000559359	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	SRGN	P10124	158 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	SBF1	O95248	1867 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	LMNB1	P20700	586 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	STYK1	Q6J9G0	422 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	MASTL	Q96GX5	879 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	CHL1	O00533	1208 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	CNKSR1	Q969H4	720 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	RRAGC	Q9HB90	399 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	HCST	Q9UBK5	93 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	SLX4	Q8IY92	1834 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	APAF1	O14727	1248 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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