RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-217ENST00000509355 TREML1Q86YW5 311 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-217ENST00000509355 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-217ENST00000509355 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-217ENST00000509355 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-217ENST00000509355 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-217ENST00000509355 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-217ENST00000509355 TNFRSF10BO14763 440 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-217ENST00000509355 C16orf46Q6P387 395 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-217ENST00000509355 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-217ENST00000509355 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 PNMA5Q96PV4 448 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 USP20Q9Y2K6 914 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 LILRB5O75023 590 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 SASH3O75995 380 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 GRIK5Q16478 980 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 GPLD1P80108 840 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 PCSK7Q16549 785 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 FAM229AH3BQW9 127 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 XYLBO75191 536 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 APBA3O96018 575 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 DOC2BQ14184 412 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 NUDT8Q8WV74 236 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 TTC9Q92623 222 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 RARAP10276 462 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 GATA4P43694 442 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-217ENST00000509355 NRLP54845 237 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 PLAURQ03405 335 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 PERM1Q5SV97 790 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 FAM35AQ86V20 835 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 A0A0A0MRY4 1105 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 ZBTB39O15060 712 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 MMP20O60882 483 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 CPB1P15086 417 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 ATP2B4P23634 1241 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 GRIK4Q16099 956 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 STIM2Q9P246 746 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 SELPP16109 830 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 SOX18P35713 384 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 SEPT3Q9UH03 358 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 ELNP15502 786 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 ITGB7P26010 798 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 MSL1Q68DK7 614 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.41□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 ZAP70P43403 619 aa9.41□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 SIK1P57059 783 aa9.41□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 NLRP13Q86W25 1043 aa9.41□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.4□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 NACC1Q96RE7 527 aa9.4□□□□□ -0.9
PDE4D-217ENST00000509355 SSFA2P28290 1259 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 ADGRE1Q14246 886 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 DTWD1Q8N5C7 304 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 C9orf172C9J069 976 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 J3QW42 95 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 PSAPP07602 524 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 SCNN1AP37088 669 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 OR13H1Q8NG92 308 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 RAC1P63000 192 aa9.37□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 MBTPS1Q14703 1052 aa9.37□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 FBXO11Q86XK2 927 aa9.37□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 ABTB2Q8N961 1025 aa9.37□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms