RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.38□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYLDQ9NQC7 956 aa7.38□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 TULP4Q9NRJ4 1543 aa7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM94Q12767 1356 aa7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 SV2AQ7L0J3 742 aa7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 MORC1Q86VD1 984 aa7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACEP12821 1306 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR37L1O60883 481 aa7.36□□□□□ -1.23
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ARHGEF3-215ENST00000498517 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NUDCQ9Y266 331 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 NWD1Q149M9 1564 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 GDF11O95390 407 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBXO45P0C2W1 286 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKARQ7Z5J8 1434 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADGRB2O60241 1585 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADAMTS2O95450 1211 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.34□□□□□ -1.23
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SLAIN2Q9P270 581 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 ITSN1Q15811 1721 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PP64 1363 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP7BP35670 1465 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 FYB1O15117 783 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 FOXO3O43524 673 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 CFAP53Q96M91 514 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 ORAI2Q96SN7 254 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 STRCP1A6NGW2 1772 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 NSD2O96028 1365 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYOM1P52179 1685 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR25O00155 361 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 TOM1O60784 492 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCTRP47872 440 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 NLRP13Q86W25 1043 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 ABTB2Q8N961 1025 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 NALCNQ8IZF0 1738 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 INSRP06213 1382 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRRC7Q96NW7 1537 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPP2R1AP30153 589 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 IRS1P35568 1242 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 DCCP43146 1447 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 DBN1Q16643 649 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PRU2 124 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZBBXA8MT70 800 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDE3BQ13370 1112 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 NME9Q86XW9 330 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 AKAP12Q02952 1782 aa7.29□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.29□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 ERVK-9P63128 1117 aa7.29□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.29□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP6P35125 1406 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP32Q8NFA0 1604 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 MEN1O00255 615 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 THBS1P07996 1170 aa7.28□□□□□ -1.24
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