RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35F4A4IF30 521 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP12.31□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 CCINQ13939 588 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 EFCC1Q9HA90 598 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 ST8SIA5O15466 376 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 EFSO43281 561 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 USPL1Q5W0Q7 1092 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 CES1P23141 567 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 LDLRAD1Q5T700 205 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 GALNT12Q8IXK2 581 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf127Q8N9H9 656 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 CRELD1Q96HD1 420 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 LCE2BO14633 110 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 TNP2Q05952 138 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM22Q8IYM9 498 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf37Q96NL8 207 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf49Q9H741 205 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 DCDC2BA2VCK2 349 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 SASH3O75995 380 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC155Q8N6L0 562 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 RNF34Q969K3 372 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 PNMA5Q96PV4 448 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 GSX2Q9BZM3 304 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 CHRDQ9H2X0 955 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 MARK1Q9P0L2 795 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 CNTN3Q9P232 1028 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 SOBPA7XYQ1 873 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 MAPTP10636 758 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 NPHS2Q9NP85 383 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 PHF20L1A8MW92 1017 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 EREGO14944 169 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 EDN3P14138 238 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF76P36508 570 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 DBN1Q16643 649 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 PPP4R2Q9NY27 417 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 FAM8A1Q9UBU6 413 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 PHF24Q9UPV7 400 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 THBS1P07996 1170 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 RARAP10276 462 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 OR13H1Q8NG92 308 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 DACH1Q9UI36 760 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 TARSP26639 723 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 IRS1P35568 1242 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 PI16Q6UXB8 463 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 KRT25Q7Z3Z0 450 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM47Q96LD4 638 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 OSBPL7Q9BZF2 842 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 BNIP3LO60238 219 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 VEGFBP49765 207 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 FANCCQ00597 558 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 NEUROD1Q13562 356 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 SUV39H2Q9H5I1 410 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 NDFIP2Q9NV92 336 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 TRAK1Q9UPV9 953 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PTPRC-212ENST00000491302 MMP20O60882 483 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 PSAPP07602 524 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 CTSHP09668 335 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 SPEM2Q0P670 501 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0319Q5VV43 1072 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 BCO2Q9BYV7 579 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 ITGA6P23229 1130 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 SOX18P35713 384 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 FOXR1Q6PIV2 292 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 NT5DC4Q86YG4 428 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K6O95382 1288 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 FAM182BQ5T319 152 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf131Q5VYM1 1079 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 NXPE4Q6UWF7 544 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 STRN4Q9NRL3 753 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 USP35Q9P2H5 1018 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 USP31Q70CQ4 1352 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 NFKB1P19838 968 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 PLAURQ03405 335 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD17AQ96GS6 310 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 TRERF1Q96PN7 1200 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 EHD4Q9H223 541 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 SALL4Q9UJQ4 1053 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 IGSF3O75054 1194 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRC-212ENST00000491302 USP17L7P0C7H9 530 aa12.16□□□□□ -0.46
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