RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422596.1

TRDN-203, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 3

Gene TRDN, Length 776 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-203ENST00000422596 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 IER5Q5VY09 327 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 C16orf46Q6P387 395 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 ITGB7P26010 798 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 GATA4P43694 442 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 DGKZQ13574 1117 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 COX20Q5RI15 118 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 NUDT8Q8WV74 236 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDN-203ENST00000422596 NFKB1P19838 968 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 INPP5BP32019 993 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 SCNN1AP37088 669 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 IDH3AP50213 366 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 CCINQ13939 588 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 GRIK4Q16099 956 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 SEPT3Q9UH03 358 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 NAGPAQ9UK23 515 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 LILRB5O75023 590 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 XP32Q5T750 250 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 KRT25Q7Z3Z0 450 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 PNMA5Q96PV4 448 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 APBA3O96018 575 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 HELQQ8TDG4 1101 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 ZFATQ9P243 1243 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 USP20Q9Y2K6 914 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 MICAL2O94851 1124 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 EFCC1Q9HA90 598 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 STIM2Q9P246 746 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 A0A0A0MRY4 1105 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 ZBTB42B2RXF5 422 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 OPLAHO14841 1288 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 SASH3O75995 380 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 SERPINB4P48594 390 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 IFT43Q96FT9 208 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 ICMTO60725 284 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 ABL1P00519 1130 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 CPB1P15086 417 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 SELPP16109 830 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 EPB42P16452 691 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 NPR3P17342 541 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 ARSDP51689 593 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 PLAURQ03405 335 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 FAM35AQ86V20 835 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 ABTB2Q8N961 1025 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-203ENST00000422596 TNFRSF10BO14763 440 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 FAM13AO94988 1023 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 ILDR2Q71H61 639 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 Q8N3U1 123 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 MAP3K6O95382 1288 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 GRIK5Q16478 980 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 PERM1Q5SV97 790 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 NACC1Q96RE7 527 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 RARAP10276 462 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 ELNP15502 786 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 TREML1Q86YW5 311 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-203ENST00000422596 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms