RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 GMNNO75496 209 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 VPS36Q86VN1 386 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 TTC36A6NLP5 189 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 ERCC3P19447 782 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 COG7P83436 770 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPP6R1Q9UPN7 881 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CFAP58Q5T655 872 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 USP25Q9UHP3 1055 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 ABCA9Q8IUA7 1624 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 SETDB1Q15047 1291 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CIB2O75838 187 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 RASSF2P50749 326 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 IRX4P78413 519 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 MORC4Q8TE76 937 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 MROH1Q8NDA8 1641 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 RUFY3Q7L099 469 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 PALMDQ9NP74 551 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 UBE2HP62256 183 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 FLIIQ13045 1269 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CAMK4Q16566 473 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 IKBKGQ9Y6K9 419 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 RALGAPBQ86X10 1494 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPFIA3O75145 1194 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 GNG11P61952 73 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPP2R5AQ15172 486 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 INF2Q27J81 1249 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CABP1Q9NZU7 370 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 PSMD7P51665 324 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CERS3Q8IU89 383 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 GCC1Q96CN9 775 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 NEDD9Q14511 834 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLMAPQ14BN4 828 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 SH3GL3Q99963 347 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 KDM5CP41229 1560 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 NDUFAB1O14561 156 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRZ1-201ENST00000393386 MUM1Q2TAK8 710 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 TBX22Q9Y458 520 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 SNCBQ16143 134 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 NUF2Q9BZD4 464 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATP5DP30049 168 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMC6Q7Z403 805 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRZ1-201ENST00000393386 PDE3AQ14432 1141 aa6.3□□□□□ -1.4
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