RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 GSDMDP57764 484 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 STK3Q13188 491 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 ADCY9O60503 1353 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 AACSQ86V21 672 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 ERBB3P21860 1342 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 PTPRUQ92729 1446 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 AGLP35573 1532 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-201ENST00000335007 DIP2BQ9P265 1576 aa23.77■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 H3BQV1 296 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 IFFO2Q5TF58 517 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 BRF1Q92994 677 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 GTF3C6Q969F1 213 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 USP16Q9Y5T5 823 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 HOXB7P09629 217 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 MED23Q9ULK4 1368 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 ANO10Q9NW15 660 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 JCADQ9P266 1359 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 NUTM2FA1L443 756 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 A0A0D9SFI3 127 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 KRT32Q14532 448 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 NWD1Q149M9 1564 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 JAK2O60674 1132 aa23.73■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 L2HGDHQ9H9P8 463 aa23.73■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.73■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.73■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.73■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 FSD1Q9BTV5 496 aa23.73■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF446Q9NWS9 450 aa23.73■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.72■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 KINO60870 393 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.71■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 TUBB4AP04350 444 aa23.71■■□□□ 1.39
PPP1CC-201ENST00000335007 ERICH4A6NGS2 130 aa23.7■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.7■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 PIK3C2AO00443 1686 aa23.7■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 ALDH1L1O75891 902 aa23.7■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.69■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 DDX11Q96FC9 970 aa23.69■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.69■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.69■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 ST7Q9NRC1 585 aa23.69■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.68■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBTB22O15209 634 aa23.68■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 KCNJ6P48051 423 aa23.68■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.68■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 CYP2C19P33261 490 aa23.67■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.67■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 ATL3Q6DD88 541 aa23.67■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.67■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 NEK1Q96PY6 1258 aa23.67■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.67■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 NRDCO43847 1150 aa23.66■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 HOXC9P31274 260 aa23.66■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.382e-7■□□□□ 8.3
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC93Q567U6 631 aa23.66■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 NBPF11Q86T75 865 aa23.66■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 FHOD1Q9Y613 1164 aa23.66■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC20A2Q08357 652 aa23.66■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.66■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.66■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.66■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.66■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 NPHP1O15259 732 aa23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms