RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 MEIS3Q99687 375 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC102BQ68D86 513 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 MCM3P25205 808 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 SPECC1Q5M775 1068 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 NSD2O96028 1365 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 C8orf37Q96NL8 207 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC174Q6PII3 467 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 JADE2Q9NQC1 790 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 KRT23Q9C075 422 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 ATP2B3Q16720 1220 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 FANCAO15360 1455 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB43O43298 467 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 ALG1Q9BT22 464 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 INCENPQ9NQS7 918 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.64■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.64■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.64■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 STAT6P42226 847 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 KANK3Q6NY19 840 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 HMGXB3Q12766 1538 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 MSH6P52701 1360 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 SDSP20132 328 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 SYKP43405 635 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 VTI1AQ96AJ9 217 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF165P49910 485 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 GSDMDP57764 484 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 RTN1Q16799 776 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 RGS22Q8NE09 1264 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZUG5 572 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 N4BP3O15049 544 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 LMAN1P49257 510 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 MAATS1Q7Z4T9 603 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 STAMBPO95630 424 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.61■■□□□ 1.69
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PTPRM-201ENST00000332175 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
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PTPRM-201ENST00000332175 TMX3Q96JJ7 454 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 SYNCQ9H7C4 482 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
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PTPRM-201ENST00000332175 ESR2Q92731 530 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 VEZTQ9HBM0 779 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 CALM1P0DP23 149 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 CALM2P0DP24 149 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 CALM3P0DP25 149 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2HP62256 183 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 ERMNQ8TAM6 284 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 NLRP3Q96P20 1036 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 TNRQ92752 1358 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 NF2P35240 595 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 NAPAP54920 295 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF354CQ86Y25 554 aa25.59■■□□□ 1.69
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PTPRM-201ENST00000332175 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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PTPRM-201ENST00000332175 RMND1Q9NWS8 449 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 JAG2Q9Y219 1238 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 GRM8O00222 908 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 CTR9Q6PD62 1173 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D5Q92609 795 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRM-201ENST00000332175 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.58■■□□□ 1.69
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