RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ric1Q69ZJ7 1422 aa26.76■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Flad1Q8R123 492 aa26.76■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 FocadA2AKG8 1798 aa26.75■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Col22a1E9Q7P1 1613 aa26.75■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Klhl34A2AI76 644 aa26.74■■□□□ 1.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Irgm2A0A140LIF8 407 aa26.74■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atf3Q60765 181 aa26.74■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa26.74■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Iffo2Q8R2V2 512 aa26.74■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lrrfip2Q91WK0 415 aa26.74■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa26.73■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm7361D3Z6R1 267 aa26.73■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa26.73■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm1979E9QAN3 267 aa26.73■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm5862K7N5V5 267 aa26.73■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm10220K7N660 267 aa26.73■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa26.73■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bmp2kQ91Z96 1138 aa26.73■■□□□ 1.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Krt85Q9Z2T6 507 aa26.73■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Syde2E9PUP1 1314 aa26.73■■□□□ 1.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc5a1Q8C3K6 665 aa26.72■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zkscan7E9PVW1 718 aa26.71■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sult6b1P0CC03 303 aa26.71■■□□□ 1.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Srgap1Q91Z69 1062 aa26.71■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa26.71■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mb21d2Q8C525 428 aa26.71■■□□□ 1.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa26.7■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ano1Q8BHY3 960 aa26.7■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp44Q8C2S0 711 aa26.7■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Erc1Q99MI1 1120 aa26.7■■□□□ 1.86
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tyro3P55144 880 aa26.7■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ubash3aQ3V3E1 624 aa26.69■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 R3hcc1Q8BSI6 488 aa26.69■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttc27Q8CD92 847 aa26.69■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TnmdQ9EP64 317 aa26.69■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 NpeppsQ11011 920 aa26.68■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 NfkbibQ60778 359 aa26.68■■□□□ 1.86
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sh3bp5Q9Z131 463 aa26.68■■□□□ 1.86
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmc2Q8R4P4 888 aa26.67■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pus3Q9JI38 481 aa26.67■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Col18a1P39061 1774 aa26.67■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cspp1B2RX88 1205 aa26.67■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atg9aQ68FE2 551 aa26.67■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Golim4Q8BXA1 655 aa26.67■■□□□ 1.86
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa26.67■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Polr3gQ6NXY9 223 aa26.66■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa26.66■■□□□ 1.86
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lnx1O70263 728 aa26.66■■□□□ 1.86
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc129Q14B48 1034 aa26.65■■□□□ 1.86
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mctp1E9PV86 951 aa26.65■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wdr78E9PYY5 807 aa26.65■■□□□ 1.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cwc25Q9DBF7 416 aa26.65■■□□□ 1.86
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp317Q8C0Q5 607 aa26.64■■□□□ 1.86
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa26.64■■□□□ 1.85
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Col4a1P02463 1669 aa26.63■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp142G5E869 1843 aa26.63■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Csrnp1P59054 583 aa26.62■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Chmp3Q9CQ10 224 aa26.62■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sos2Q02384 1333 aa26.62■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa26.62■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp2d10P24456 504 aa26.62■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 ZyxQ62523 564 aa26.62■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa26.62■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam102bQ8BQS4 339 aa26.62■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa26.62■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
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