RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000054930.6

Ptx4-201, Transcript of Pentraxin-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptx4, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa16.95■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Atp8a2P98200 1148 aa16.95■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 EgfrQ01279 1210 aa16.95■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa16.95■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 NfkbibQ60778 359 aa16.95■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa16.95■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 HlfQ8BW74 295 aa16.95■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tango6Q8C3S2 1079 aa16.95■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gcc1Q9D4H2 778 aa16.95■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Adarb2Q9JI20 745 aa16.95■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nphp3Q7TNH6 1325 aa16.95■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Scn11aQ9R053 1765 aa16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 1700029H14RikE9PY36 240 aa16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Q8C6G1 249 aa16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cetn4Q8K4K1 168 aa16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Chmp3Q9CQ10 224 aa16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Myo3bQ1EG27 1305 aa16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Brpf1B2RRD7 1212 aa16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Oas2E9Q9A9 742 aa16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Plbd2Q3TCN2 594 aa16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 B4galnt3Q6L8S8 986 aa16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 CpvlQ9D3S9 478 aa16.94■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Timm10P62073 90 aa16.93■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam228bQ497Q6 232 aa16.93■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 DbnlQ62418 436 aa16.93■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nup188Q6ZQH8 1759 aa16.93■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 IarsQ8BU30 1262 aa16.93■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Plekho1Q9JIY0 408 aa16.93■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Bcar3Q9QZK2 820 aa16.93■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pde8bE9Q4S1 865 aa16.92■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ccdc146E9Q9F7 977 aa16.92■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Celf1P28659 486 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 NfixP70257 488 aa16.92■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cgnl1Q6AW69 1298 aa16.92■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Wdr63B2RY71 923 aa16.91■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cfap70D3YVL2 1141 aa16.91■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ccdc27Q3V036 639 aa16.91■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fbxo3Q9DC63 480 aa16.91■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa16.91■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Phrf1A6H619 1682 aa16.91■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 GabrdP22933 449 aa16.9■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rad23bP54728 416 aa16.9■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kif18aQ91WD7 886 aa16.9■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa16.9■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Naa16Q9DBB4 864 aa16.9■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zfp831A2ADM8 1628 aa16.9■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Slc4a1P04919 929 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mcm2P97310 904 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Plcd4Q8K3R3 807 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tmem143Q8VD26 458 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 UvssaQ9D479 717 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 EspnQ9ET47 871 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 En2P09066 324 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Neurod6P48986 337 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dok7Q18PE0 504 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Bend4P86174 541 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zbtb45Q52KG4 520 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cyp2c67Q569X9 491 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Insm1Q63ZV0 521 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Asap2Q7SIG6 958 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Slc26a8Q8R0C3 999 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Taf5lQ91WQ5 589 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam84aQ9D650 292 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ccne2Q9Z238 404 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kcnq2Q9Z351 759 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tgfb2P27090 414 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sept1P42209 366 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dydc2Q9D3X8 139 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kcnq5Q9JK45 933 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Atp2b3Q0VF55 1220 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gsdma2Q32M21 443 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 ZyxQ62523 564 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sptlc3Q8BG54 563 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Slc51aQ8R000 340 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Taf1dQ9D4V4 322 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Osbpl5Q9ER64 874 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Slfn1Q9Z0I7 337 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm4340L7N2C4 268 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Il15P48346 162 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rhbdl3P58873 404 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 IntuQ059U7 942 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Best3Q6H1V1 669 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Camkk2Q8C078 588 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cog6Q8R3I3 657 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.7 ms