RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487320.5

CLHC1-212, Transcript of clathrin heavy chain linker domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLHC1, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1-212ENST00000487320 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa3.91□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 RWDD2AQ9UIY3 292 aa3.91□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.91□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa3.91□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.91□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 DOCK7Q96N67 2140 aa3.91□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 PATJQ8NI35 1801 aa3.91□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 CACNA1BQ00975 2339 aa3.9□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 ATG2BQ96BY7 2078 aa3.9□□□□□ -1.78
CLHC1-212ENST00000487320 A0A087WW49 117 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 LRIT2A6NDA9 550 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 BTN3A3O00478 584 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF264O43296 627 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 SEMA4FO95754 770 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 APOEP02649 317 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 F7P08709 466 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 PRSS56P0CW18 603 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 CCR1P32246 355 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 CD70P32970 193 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 TIMP3P35625 211 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 PEX19P40855 299 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 CSKP41240 450 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 GRIA1P42261 906 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 PLK1P53350 603 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ACTR3P61158 418 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 RPS24P62847 133 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 EXOC3L4Q17RC7 722 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 C9orf64Q5T6V5 341 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 SYPL2Q5VXT5 272 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 HOGA1Q86XE5 327 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 SLC22A9Q8IVM8 553 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ICA1LQ8NDH6 482 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 BIRC7Q96CA5 298 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 OR4F4Q96R69 305 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 NPY6RQ99463 290 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 APOOQ9BUR5 198 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 METTL7AQ9H8H3 244 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 MED20Q9H944 212 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF556Q9HAH1 456 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 PLEKHA3Q9HB20 300 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 FBXL12Q9NXK8 326 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 KLRF1Q9NZS2 232 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 EMCNQ9ULC0 261 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ICAM5Q9UMF0 924 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ERVW-1Q9UQF0 538 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 TSC2P49815 1807 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 CHD8Q9HCK8 2581 aa3.9□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 PCNX2A6NKB5 2137 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 FAM47DPA6NHR8 397 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF716A6NP11 495 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 F5H5T6 163 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 SLCO1B7G3V0H7 640 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 G3V2L1 256 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 K7EQD1 137 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 PDLIM1O00151 329 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 INPP4BO15327 924 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF208O43345 1280 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 DUX1O43812 170 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 MAGEC1O60732 1142 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ERLIN1O75477 346 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 CLDN11O75508 207 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 RHBDL1O75783 438 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 NXPH4O95158 308 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 IGLV3-25P01717 112 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 IGHEP01854 428 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF735P0CB33 412 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 CDK4P11802 303 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 TPSB2P20231 275 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 CCNCP24863 283 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 FCGR2CP31995 323 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 NUDT1P36639 197 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ID1P41134 155 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 C21orf59P57076 290 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 TPSAB1Q15661 275 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 CST6Q15828 149 aa3.89□□□□□ -1.79
CLHC1-212ENST00000487320 SYPL1Q16563 259 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms