RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hist1h2anC0HKE7 130 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hist1h2aoC0HKE8 130 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hist1h2apC0HKE9 130 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam46aD3Z5S8 447 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr592E9PYB3 312 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc188F6WEU2 249 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn1r86L7N213 316 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Brd7O88665 651 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CtsdP18242 410 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ptpn6P29351 595 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Map2k4P47809 397 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gbx1P82976 418 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dcp1bQ3U564 578 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ube2zQ3UE37 356 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hist3h2aQ8BFU2 130 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Reep1Q8BGH4 201 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fem1abQ8C0T1 654 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Inpp5kQ8C5L6 468 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hist1h2afQ8CGP5 130 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hist1h2ahQ8CGP6 128 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hist1h2akQ8CGP7 130 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kctd11Q8K485 232 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chchd4Q8VEA4 139 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lpcat3Q91V01 487 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GhitmQ91VC9 346 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dll4Q9JI71 686 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PrkraQ9WTX2 313 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 9930021J03RikH3BKP8 2027 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr1375A0A0N4SUP0 313 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm13090A2A899 111 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr1076A2AK60 313 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp2w1E9Q816 493 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 TspearJ3S6Y1 670 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ulk1O70405 1051 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hnrnpa2b1O88569 353 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gpx5P21765 221 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NdnP25233 325 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fcgr1P26151 404 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fbxo40P62932 710 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wbp1P97764 304 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem64Q3U145 381 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spc25Q3UA16 226 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MagixQ4KL35 324 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spata13Q5DU57 656 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr594Q7TRR4 311 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fbxw13Q8BI57 466 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ndrg4Q8BTG7 352 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rdh1Q8CGV4 317 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NmbQ9CR53 121 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Phf19Q9CXG9 578 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc19a2Q9EQN9 498 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Socs6Q9JLY0 533 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Abhd1Q9QZC8 412 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stub1Q9WUD1 304 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sema4gQ9WUH7 837 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm7173A0A0G2JEB6 3132 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm37596A0A0A6YXL2 336 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp169E9Q3R6 731 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm20828J3KMI7 228 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plscr5J3QM92 274 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn2r51L7N215 852 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stc1O55183 247 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Csf1P07141 552 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sod2P09671 222 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp14P10755 501 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Efna1P52793 205 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc12a3P59158 1002 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgef15Q5FWH6 849 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Laptm4aQ60961 233 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AY358078Q6UY53 465 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Calm5Q6W3E0 140 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 B3gnt5Q8BGY6 376 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pi15Q8BS03 258 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gpr22Q8BZL4 432 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ssuh2Q8C3L1 340 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Faim2Q8K097 317 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr561Q8VGZ6 314 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sfxn5Q925N0 342 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 TympQ99N42 471 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lap3Q9CPY7 519 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 HypmQ9CR04 117 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nubp2Q9R061 275 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mbd2Q9Z2E1 414 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm17190V9GX38 357 aa8.35□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp114B2RRA8 586 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pgam2O70250 253 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GlulP15105 373 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Igfbp1P47876 272 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Epb42P49222 691 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CckbrP56481 453 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ctbp2P56546 445 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Taf13P61216 124 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Uap1l1Q3TW96 507 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krtcap2Q5RL79 136 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lrrn1Q61809 716 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cntn4Q69Z26 1026 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adamtsl4Q80T21 1036 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rtp2Q80ZI2 223 aa8.34□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf770Q8BIQ8 705 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.3 ms