Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Gbx1P82976 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Gbx1P82976 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gbx1P82976 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gbx1P82976 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gbx1P82976 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gbx1P82976 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Gbx1P82976 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Gbx1P82976 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gbx1P82976 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gbx1P82976 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gbx1P82976 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Gbx1P82976 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gbx1P82976 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gbx1P82976 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Gbx1P82976 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gbx1P82976 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gbx1P82976 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Gbx1P82976 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gbx1P82976 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gbx1P82976 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gbx1P82976 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gbx1P82976 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gbx1P82976 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gbx1P82976 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gbx1P82976 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gbx1P82976 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gbx1P82976 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gbx1P82976 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gbx1P82976 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gbx1P82976 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gbx1P82976 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gbx1P82976 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Gbx1P82976 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gbx1P82976 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gbx1P82976 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gbx1P82976 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gbx1P82976 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gbx1P82976 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gbx1P82976 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gbx1P82976 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gbx1P82976 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gbx1P82976 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gbx1P82976 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gbx1P82976 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Gbx1P82976 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gbx1P82976 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gbx1P82976 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gbx1P82976 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gbx1P82976 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gbx1P82976 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gbx1P82976 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gbx1P82976 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gbx1P82976 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gbx1P82976 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gbx1P82976 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gbx1P82976 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gbx1P82976 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gbx1P82976 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Gbx1P82976 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gbx1P82976 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gbx1P82976 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gbx1P82976 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gbx1P82976 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gbx1P82976 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gbx1P82976 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gbx1P82976 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gbx1P82976 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gbx1P82976 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gbx1P82976 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gbx1P82976 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gbx1P82976 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gbx1P82976 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gbx1P82976 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gbx1P82976 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gbx1P82976 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gbx1P82976 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gbx1P82976 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gbx1P82976 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gbx1P82976 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gbx1P82976 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gbx1P82976 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gbx1P82976 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gbx1P82976 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gbx1P82976 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gbx1P82976 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gbx1P82976 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gbx1P82976 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gbx1P82976 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gbx1P82976 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gbx1P82976 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gbx1P82976 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gbx1P82976 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gbx1P82976 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gbx1P82976 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gbx1P82976 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gbx1P82976 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gbx1P82976 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gbx1P82976 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gbx1P82976 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms