Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,3■■■■□ 3,08
CckbrP56481 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
CckbrP56481 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
CckbrP56481 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
CckbrP56481 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
CckbrP56481 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,37■■■□□ 2,45
CckbrP56481 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
CckbrP56481 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
CckbrP56481 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
CckbrP56481 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
CckbrP56481 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
CckbrP56481 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
CckbrP56481 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
CckbrP56481 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
CckbrP56481 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
CckbrP56481 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
CckbrP56481 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
CckbrP56481 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
CckbrP56481 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
CckbrP56481 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
CckbrP56481 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
CckbrP56481 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
CckbrP56481 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
CckbrP56481 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
CckbrP56481 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
CckbrP56481 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
CckbrP56481 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
CckbrP56481 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
CckbrP56481 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,97■■■□□ 2,07
CckbrP56481 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
CckbrP56481 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
CckbrP56481 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,78■■■□□ 2,04
CckbrP56481 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
CckbrP56481 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
CckbrP56481 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
CckbrP56481 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
CckbrP56481 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
CckbrP56481 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,28■■□□□ 1,96
CckbrP56481 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
CckbrP56481 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
CckbrP56481 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
CckbrP56481 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
CckbrP56481 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
CckbrP56481 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
CckbrP56481 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
CckbrP56481 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,96■■□□□ 1,91
CckbrP56481 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
CckbrP56481 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
CckbrP56481 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
CckbrP56481 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
CckbrP56481 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
CckbrP56481 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
CckbrP56481 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
CckbrP56481 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,83■■□□□ 1,88
CckbrP56481 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
CckbrP56481 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,68■■□□□ 1,86
CckbrP56481 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
CckbrP56481 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
CckbrP56481 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,58■■□□□ 1,85
CckbrP56481 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
CckbrP56481 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,55■■□□□ 1,84
CckbrP56481 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
CckbrP56481 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
CckbrP56481 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
CckbrP56481 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,44■■□□□ 1,82
CckbrP56481 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
CckbrP56481 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
CckbrP56481 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
CckbrP56481 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
CckbrP56481 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
CckbrP56481 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
CckbrP56481 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
CckbrP56481 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,28■■□□□ 1,8
CckbrP56481 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
CckbrP56481 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,21■■□□□ 1,79
CckbrP56481 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
CckbrP56481 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
CckbrP56481 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
CckbrP56481 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,16■■□□□ 1,78
CckbrP56481 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,06■■□□□ 1,76
CckbrP56481 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
CckbrP56481 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
CckbrP56481 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
CckbrP56481 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
CckbrP56481 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
CckbrP56481 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
CckbrP56481 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
CckbrP56481 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
CckbrP56481 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
CckbrP56481 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
CckbrP56481 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
CckbrP56481 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
CckbrP56481 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
CckbrP56481 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
CckbrP56481 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
CckbrP56481 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
CckbrP56481 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
CckbrP56481 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
CckbrP56481 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,64■■□□□ 1,7
CckbrP56481 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms