Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CckbrP56481 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CckbrP56481 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CckbrP56481 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CckbrP56481 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CckbrP56481 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CckbrP56481 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CckbrP56481 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CckbrP56481 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CckbrP56481 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CckbrP56481 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CckbrP56481 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CckbrP56481 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CckbrP56481 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CckbrP56481 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CckbrP56481 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CckbrP56481 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CckbrP56481 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CckbrP56481 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CckbrP56481 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CckbrP56481 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CckbrP56481 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CckbrP56481 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CckbrP56481 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CckbrP56481 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CckbrP56481 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CckbrP56481 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CckbrP56481 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CckbrP56481 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CckbrP56481 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CckbrP56481 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CckbrP56481 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CckbrP56481 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CckbrP56481 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CckbrP56481 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CckbrP56481 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CckbrP56481 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CckbrP56481 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CckbrP56481 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CckbrP56481 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CckbrP56481 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CckbrP56481 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CckbrP56481 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CckbrP56481 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CckbrP56481 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CckbrP56481 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CckbrP56481 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CckbrP56481 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CckbrP56481 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CckbrP56481 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CckbrP56481 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CckbrP56481 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CckbrP56481 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CckbrP56481 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CckbrP56481 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CckbrP56481 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CckbrP56481 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CckbrP56481 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CckbrP56481 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CckbrP56481 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CckbrP56481 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CckbrP56481 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CckbrP56481 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CckbrP56481 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CckbrP56481 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CckbrP56481 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CckbrP56481 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CckbrP56481 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CckbrP56481 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CckbrP56481 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CckbrP56481 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CckbrP56481 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CckbrP56481 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CckbrP56481 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CckbrP56481 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CckbrP56481 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CckbrP56481 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CckbrP56481 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CckbrP56481 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CckbrP56481 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CckbrP56481 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CckbrP56481 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CckbrP56481 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CckbrP56481 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CckbrP56481 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CckbrP56481 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CckbrP56481 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CckbrP56481 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CckbrP56481 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CckbrP56481 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CckbrP56481 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CckbrP56481 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CckbrP56481 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CckbrP56481 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CckbrP56481 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CckbrP56481 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CckbrP56481 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CckbrP56481 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CckbrP56481 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CckbrP56481 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms