RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 PRKAG1P54619 331 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SCGB2A2Q13296 93 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 RCN1Q15293 331 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SWI5Q1ZZU3 235 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 PRSS53Q2L4Q9 553 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 RINLQ6ZS11 566 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 LINC01356Q8N9X3 169 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 HPS1Q92902 700 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 CCDC126Q96EE4 140 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 FBXO17Q96EF6 278 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 MRGPRX4Q96LA9 322 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 MUS81Q96NY9 551 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 KLHDC3Q9BQ90 382 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ASB6Q9NWX5 421 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 TAS2R16Q9NYV7 291 aa10.51□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 A0A1W2PR80 420 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 MAGEA13PA6NCF6 341 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SUPT7LO94864 414 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 VENTXO95231 258 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 RPSAP08865 295 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 EDNRAP25101 427 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 CHN2P52757 468 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 NAA20P61599 178 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ZNF117Q03924 483 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SELENBP1Q13228 472 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 MLC1Q15049 377 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 CD226Q15762 336 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 MST1LQ2TV78 715 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 FAM71E1Q6IPT2 247 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 EPGNQ6UW88 154 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 TREML1Q86YW5 311 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ZNF527Q8NB42 609 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 APH1AQ96BI3 265 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SORCS2Q96PQ0 1159 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 RAP2CQ9Y3L5 183 aa10.5□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 A0A1W2PNR3 127 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 TMEM89A2RUT3 159 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 LRP5LA4QPB2 252 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 A8MT66 165 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 NPIPA7E9PJI5 369 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 NPHS1O60500 1241 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 IGHV3-9P01782 118 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ALOX5P09917 674 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 NPIPA8P0DM63 369 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 PRKCAP17252 672 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 CALRP27797 417 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 IDH3AP50213 366 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 DNAJB13P59910 316 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 HSPB3Q12988 150 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 PDK3Q15120 406 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 GABRA6Q16445 453 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ZYG11AQ6WRX3 759 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 IKBIPQ70UQ0 350 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SZRD1Q7Z422 152 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ZAR1Q86SH2 424 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 HOMEZQ8IX15 550 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 COX18Q8N8Q8 333 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SLC16A11Q8NCK7 471 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 NUP43Q8NFH3 380 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 OR5B2Q96R09 309 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ZNF382Q96SR6 550 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SORT1Q99523 831 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SOX7Q9BT81 388 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 HOXD1Q9GZZ0 328 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 OXSMQ9NWU1 459 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SLC7A8Q9UHI5 535 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SCOCQ9UIL1 159 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ICAM5Q9UMF0 924 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 TRAF6Q9Y4K3 522 aa10.49□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 SERTM1A2A2V5 107 aa10.48□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 FAM157AC9JC47 383 aa10.48□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 GPR171O14626 319 aa10.48□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 HDAC3O15379 428 aa10.48□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ENO1P06733 434 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ACP2P11117 423 aa10.48□□□□□ -0.73
SPC25-201ENST00000282074 ANPEPP15144 967 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms