RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266079.4

PRPF6-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF6, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6-201ENST00000266079 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 DLL4Q9NR61 685 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 IRGMA1A4Y4 181 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 HLA-DPB1P04440 258 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 RAB40BQ12829 278 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 ERV3-1Q14264 604 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 PRSS58Q8IYP2 241 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 OR1L3Q8NH93 324 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 TM4SF18Q96CE8 201 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 TM4SF19Q96DZ7 209 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 SARGQ9BW04 601 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 APMAPQ9HDC9 416 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 SDHAF2Q9NX18 166 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRPF6-201ENST00000266079 M0R233 179 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 GPR171O14626 319 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 PGRMC2O15173 223 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 TCRBP04435 133 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 ACP2P11117 423 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 OR1D4P47884 311 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 NUBP1P53384 320 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 GINS1Q14691 196 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 TFAP2EQ6VUC0 442 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 OR2T4Q8NH00 348 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 FGF11Q92914 225 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 PTP4A1Q93096 173 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 RNFT2Q96EX2 444 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 OR6C1Q96RD1 312 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 CDCP1Q9H5V8 836 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 IFT46Q9NQC8 304 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 CYSLTR2Q9NS75 346 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 GLS2Q9UI32 602 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 PLCL2Q9UPR0 1127 aa11.65□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 GABRPO00591 440 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 LALBAP00709 142 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 H1F0P07305 194 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 LIMS3P0CW19 117 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 LIMS4P0CW20 117 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 SOX18P35713 384 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 CD79BP40259 229 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 RUNX2Q13950 521 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 CSRP2Q16527 193 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 TMEM35AQ53FP2 167 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 DEFB124Q8NES8 71 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 OR5AK3PQ8NH89 298 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 HSD17B8Q92506 261 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 TMED9Q9BVK6 235 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 ATPIF1Q9UII2 106 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 PIEZO1Q92508 2521 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 A0A1W2PR48 441 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 MFSD2BA6NFX1 497 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 D6RAR5 112 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 SEMA7AO75326 666 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 SHC2P98077 582 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 COX10Q12887 443 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 CLVS2Q5SYC1 327 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 ACSM5Q6NUN0 579 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 TCTN3Q6NUS6 607 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 DHRS13Q6UX07 377 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 ABHD13Q7L211 337 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 ZNF485Q8NCK3 441 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 OR8D4Q8NGM9 314 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 OR5M3Q8NGP4 307 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 PPCDCQ96CD2 204 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 CD180Q99467 661 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 REEP4Q9H6H4 257 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 SESN1Q9Y6P5 492 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 A0A0A6YYD5 115 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 OR12D1P0DN82 309 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 CCL4P13236 92 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 GIPRP48546 466 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 DSTNP60981 165 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 EFNB1P98172 346 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 STPG1Q5TH74 334 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 ASCL5Q7RTU5 278 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 SZRD1Q7Z422 152 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PRPF6-201ENST00000266079 SLC30A8Q8IWU4 369 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms