RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 OR5M10Q6IEU7 315 aa20.63■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa20.63■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 GLRX5Q86SX6 157 aa20.63■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 BBS1Q8NFJ9 593 aa20.63■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 OR10G3Q8NGC4 313 aa20.63■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 LGALS12Q96DT0 336 aa20.63■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 FN3KQ9H479 309 aa20.63■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 ZNF160Q9HCG1 818 aa20.63■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 TRIM64BA6NI03 449 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 FAM183AA6NL82 134 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 CCNA2P20248 432 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 CXCR1P25024 350 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 MTNR1AP48039 350 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 TIGD6Q17RP2 521 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 BICRALQ6AI39 1079 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 LIPHQ8WWY8 451 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 TAPBPLQ9BX59 468 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 TAS2R10Q9NYW0 307 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 CFAP54Q96N23 3096 aa20.62■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 B4DXG7 233 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 ITGA10O75578 1167 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 RAB40BQ12829 278 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 STPG1Q5TH74 334 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 RNLSQ5VYX0 342 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 FCRLBQ6BAA4 426 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 PLBD1Q6P4A8 553 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 POMZP3Q6PJE2 187 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 MOGAT1Q96PD6 335 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 KLRF1Q9NZS2 232 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 CLEC2DQ9UHP7 191 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 RAB36O95755 333 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 PEPDP12955 493 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 OTX2P32243 289 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 PTGDSP41222 190 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 SOX3P41225 446 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 ZNF367Q7RTV3 350 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 C10orf53Q8N6V4 93 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 OR5M11Q96RB7 305 aa20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 SDK2Q58EX2 2172 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 IRGMA1A4Y4 181 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 ANKUB1A6NFN9 424 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 MCIDASD6RGH6 385 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 NR4A1P22736 598 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 HTR1FP30939 366 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 TGFBR2P37173 567 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 LIPAP38571 399 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 LTBQ06643 244 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 LSAMPQ13449 338 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 GXYLT1Q4G148 440 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 GRINAQ7Z429 371 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 IGFN1Q86VF2 1251 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 OTULINQ96BN8 352 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 NANSQ9NR45 359 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 PCNX3Q9H6A9 2034 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 RIIAD1A6NNX1 92 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 APOL3O95236 402 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 SSPNQ14714 243 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 CTF1Q16619 201 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 P2RY8Q86VZ1 359 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 ESX1Q8N693 406 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 TAAR8Q969N4 342 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 METTL7AQ9H8H3 244 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 MED20Q9H944 212 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 FAM86C1Q9NVL1 165 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 CHRNA9Q9UGM1 479 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 ERGIC3Q9Y282 383 aa20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 A0A1W2PPW3 197 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 PCNX2A6NKB5 2137 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 GABARAPO95166 117 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 ASAH2BP0C7U1 165 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 CDK4P11802 303 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 CD36P16671 472 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 HK1P19367 917 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 NOS3P29474 1203 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 RPS15P62841 145 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 MED22Q15528 200 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 NIPAL3Q6P499 406 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 ADGRG3Q86Y34 549 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 GID4Q8IVV7 300 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 DEFB124Q8NES8 71 aa20.59■□□□□ 0.89
RNF170-201ENST00000240159 HCAR1Q9BXC0 346 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.6 ms