RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000224820.1

Zkscan3-208, Transcript of Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

BASIC

Gene Zkscan3, Length 5,398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 RlimQ9WTV7 600 aa14.91□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Lrp5Q91VN0 1614 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tmed7D3YZZ5 224 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gstp3F6RWR5 210 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Bcl2l11O54918 196 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 IlkO55222 452 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Igh-1aP01865 398 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tas2r120Q7M721 295 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pck2Q8BH04 640 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Fam109aQ8BH49 266 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Mettl2Q8BMK1 389 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 FntbQ8K2I1 437 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Vmn1r229Q8R2A9 306 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Mfsd6lQ8R3N2 586 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Slamf9Q9D780 285 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Snap29Q9ERB0 260 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 NpvfQ9ESQ8 188 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Acox1Q9R0H0 661 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Zfp712E9PXJ4 705 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Slc6a18O88576 615 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cd63P41731 238 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Mtf1Q07243 675 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tmem64Q3U145 381 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 FcrlbQ5DRQ8 427 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Usf2Q64705 346 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 D11Wsu47eQ6PIX9 558 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Poldip3Q8BG81 420 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Fam96bQ9D187 163 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Srd5a3Q9WUP4 330 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 FocadA2AKG8 1798 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Phrf1A6H619 1682 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Olfr1555-ps1A0A140LHT7 321 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rpl3lE9PWZ3 407 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Coq10aE9Q3H6 259 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Vmn2r28L7N203 852 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm3633L7N233 213 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm9611L7N476 213 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 ComtO88587 265 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gsc2P56916 198 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tmem104Q3TB48 496 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Slc27a5Q4LDG0 689 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 NelfaQ8BG30 530 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 SynprQ8BGN8 265 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Elac1Q8VEB6 362 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 TardbpQ921F2 414 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Lrrc18Q9CQ07 262 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 IckQ9JKV2 629 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cd163l1A0A1B0GSB0 991 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Obp1bA2AEP0 171 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm14743A2BHD2 171 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Olfr294F7CWV4 335 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Bet1O35623 118 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Hbb-bh1P04444 147 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 CpoxP36552 443 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Adamts19P59509 1210 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Spata6Q3U6K5 488 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Olfr787Q7TRI1 312 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Otop1Q80VM9 600 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Wdr92Q8BGF3 357 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Lrrc20Q8CI70 184 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Q91V76 315 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Slc7a11Q9WTR6 502 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Olfr740E9PV79 311 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 CluQ06890 448 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Reps2Q80XA6 521 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 RbksQ8R1Q9 323 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Vmn1r81Q8R286 306 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tcf19Q99KJ5 263 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 RgccQ9DBX1 137 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Raet1dQ9JI58 249 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Lcn11A2BHR2 178 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Matn3O35701 481 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Klhl9Q6ZPT1 617 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tas2r39Q7TQA5 319 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tbl1xr1Q8BHJ5 514 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Vmn1r210Q8R274 306 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Atg5Q99J83 275 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Bex4Q9CWT2 118 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Stpg4Q9DAG5 247 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ca7Q9ERQ8 264 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm13539A0A1B0GSM6 183 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Mpeg1A1L314 713 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pcsk6F6XJP7 959 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm21833J3QPK1 500 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 PtgdsO09114 189 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Hbb-bh0P04443 147 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 MpoP11247 718 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 InhbcP55104 352 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Fgf13P70377 245 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Irgm1Q60766 409 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Trim46Q7TNM2 759 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ticam1Q80UF7 732 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rhox11Q810N8 206 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Dusp15Q8R4V2 235 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 NifkQ91VE6 317 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Kti12Q9D1R2 351 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tnfsf13Q9D777 241 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 GabarapQ9DCD6 117 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.9 ms