Protein–RNA interactions for Protein: O35701

Matn3, Matrilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn3O35701 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Matn3O35701 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Matn3O35701 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Matn3O35701 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Matn3O35701 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Matn3O35701 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Matn3O35701 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Matn3O35701 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Matn3O35701 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Matn3O35701 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Matn3O35701 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Matn3O35701 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Matn3O35701 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Matn3O35701 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Matn3O35701 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Matn3O35701 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Matn3O35701 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Matn3O35701 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Matn3O35701 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Matn3O35701 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Matn3O35701 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Matn3O35701 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Matn3O35701 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Matn3O35701 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Matn3O35701 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Matn3O35701 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Matn3O35701 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Matn3O35701 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Matn3O35701 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Matn3O35701 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Matn3O35701 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Matn3O35701 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Matn3O35701 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Matn3O35701 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Matn3O35701 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Matn3O35701 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Matn3O35701 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Matn3O35701 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Matn3O35701 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Matn3O35701 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Matn3O35701 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Matn3O35701 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Matn3O35701 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Matn3O35701 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Matn3O35701 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Matn3O35701 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Matn3O35701 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Matn3O35701 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Matn3O35701 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Matn3O35701 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Matn3O35701 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Matn3O35701 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Matn3O35701 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Matn3O35701 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Matn3O35701 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Matn3O35701 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Matn3O35701 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Matn3O35701 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Matn3O35701 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Matn3O35701 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Matn3O35701 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Matn3O35701 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Matn3O35701 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Matn3O35701 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Matn3O35701 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Matn3O35701 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Matn3O35701 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Matn3O35701 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Matn3O35701 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Matn3O35701 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Matn3O35701 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Matn3O35701 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Matn3O35701 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Matn3O35701 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Matn3O35701 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Matn3O35701 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Matn3O35701 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Matn3O35701 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Matn3O35701 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Matn3O35701 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Matn3O35701 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Matn3O35701 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Matn3O35701 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Matn3O35701 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Matn3O35701 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Matn3O35701 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Matn3O35701 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Matn3O35701 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Matn3O35701 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Matn3O35701 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Matn3O35701 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Matn3O35701 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Matn3O35701 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Matn3O35701 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Matn3O35701 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Matn3O35701 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Matn3O35701 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Matn3O35701 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Matn3O35701 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Matn3O35701 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.5 ms