Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH04

Pck2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pck2Q8BH04 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Pck2Q8BH04 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pck2Q8BH04 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pck2Q8BH04 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Pck2Q8BH04 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pck2Q8BH04 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pck2Q8BH04 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Pck2Q8BH04 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Pck2Q8BH04 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pck2Q8BH04 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pck2Q8BH04 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Pck2Q8BH04 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pck2Q8BH04 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pck2Q8BH04 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Pck2Q8BH04 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pck2Q8BH04 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pck2Q8BH04 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pck2Q8BH04 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pck2Q8BH04 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pck2Q8BH04 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pck2Q8BH04 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pck2Q8BH04 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pck2Q8BH04 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pck2Q8BH04 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pck2Q8BH04 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pck2Q8BH04 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Pck2Q8BH04 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pck2Q8BH04 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pck2Q8BH04 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pck2Q8BH04 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pck2Q8BH04 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pck2Q8BH04 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pck2Q8BH04 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pck2Q8BH04 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pck2Q8BH04 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pck2Q8BH04 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pck2Q8BH04 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pck2Q8BH04 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pck2Q8BH04 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pck2Q8BH04 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pck2Q8BH04 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pck2Q8BH04 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pck2Q8BH04 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pck2Q8BH04 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Pck2Q8BH04 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pck2Q8BH04 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pck2Q8BH04 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pck2Q8BH04 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Pck2Q8BH04 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pck2Q8BH04 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pck2Q8BH04 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pck2Q8BH04 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pck2Q8BH04 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pck2Q8BH04 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pck2Q8BH04 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pck2Q8BH04 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pck2Q8BH04 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pck2Q8BH04 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pck2Q8BH04 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pck2Q8BH04 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pck2Q8BH04 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pck2Q8BH04 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pck2Q8BH04 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pck2Q8BH04 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pck2Q8BH04 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pck2Q8BH04 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pck2Q8BH04 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pck2Q8BH04 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pck2Q8BH04 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pck2Q8BH04 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pck2Q8BH04 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pck2Q8BH04 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pck2Q8BH04 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pck2Q8BH04 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pck2Q8BH04 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pck2Q8BH04 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pck2Q8BH04 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pck2Q8BH04 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pck2Q8BH04 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pck2Q8BH04 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pck2Q8BH04 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pck2Q8BH04 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pck2Q8BH04 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pck2Q8BH04 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pck2Q8BH04 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pck2Q8BH04 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pck2Q8BH04 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pck2Q8BH04 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pck2Q8BH04 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pck2Q8BH04 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pck2Q8BH04 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pck2Q8BH04 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pck2Q8BH04 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pck2Q8BH04 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pck2Q8BH04 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pck2Q8BH04 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pck2Q8BH04 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pck2Q8BH04 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pck2Q8BH04 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pck2Q8BH04 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms