RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527217.1

AP003499.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AP003499.1, Length 574 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP003499.1-201ENST00000527217 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.13□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.13□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 CDS1Q92903 461 aa7.13□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 DNAJA3Q96EY1 480 aa7.13□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 CHMP6Q96FZ7 201 aa7.13□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 HOXD1Q9GZZ0 328 aa7.13□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.13□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.13□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 MALT1Q9UDY8 824 aa7.13□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.13□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 B9A039 149 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 FAM157AC9JC47 383 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 GPR171O14626 319 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 ZNF264O43296 627 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 AKAP10O43572 662 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 IGLV1-40P01703 118 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 INHBAP08476 426 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 DAOP14920 347 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 PHBP35232 272 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 SERPINB9P50453 376 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 CCR4P51679 360 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 ATP12AP54707 1039 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 LCP2Q13094 533 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 CBFBQ13951 182 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 KIAA0040Q15053 153 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 TRIP10Q15642 601 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 CCDC103Q8IW40 242 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 ZNF614Q8N883 585 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 ARL8AQ96BM9 186 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 SNX18Q96RF0 628 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 STACQ99469 402 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 RAB17Q9H0T7 212 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 PIGUQ9H490 435 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 MID1IP1Q9NPA3 183 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 DUSP22Q9NRW4 184 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 SERINC1Q9NRX5 453 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 CA10Q9NS85 328 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 SH3BP4Q9P0V3 963 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 UPB1Q9UBR1 384 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 DTNAQ9Y4J8 743 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 KCNE3Q9Y6H6 103 aa7.12□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 NPIPB9F8W1W9 429 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 KLF11O14901 512 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 SEC22BO75396 215 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 CYP7B1O75881 506 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 WNT11O96014 354 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 OR4A8P0C604 315 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 TFPIP10646 304 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 UBL4AP11441 157 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 CREB1P16220 341 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 PGCP20142 388 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 PPOXP50336 477 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 SLC16A1P53985 500 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 PRKAA2P54646 552 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 SESN3P58005 492 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 PRPS1P60891 318 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 DEFA6Q01524 100 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 MERTKQ12866 999 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 CCNIQ14094 377 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 ADIPOQQ15848 244 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 SYT14P1Q58G82 188 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 DCST2Q5T1A1 773 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 VHLLQ6RSH7 139 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 CASP12Q6UXS9 341 aa7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
AP003499.1-201ENST00000527217 PIGXQ8TBF5 258 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms