RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 CHRNEQ04844 493 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 SPOCK1Q08629 439 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF141Q15928 474 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 NRF1Q16656 503 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 SYT14P1Q58G82 188 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 AGAP6Q5VW22 663 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 PODNL1Q6PEZ8 512 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM108Q6UXF1 575 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 HMGN2P46Q86SG4 172 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 DTX2Q86UW9 622 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 OR4A15Q8NGL6 344 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 HTRA1Q92743 480 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 APH1AQ96BI3 265 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 PPP1R36Q96LQ0 422 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF350Q9GZX5 532 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 CTPS2Q9NRF8 586 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 ACER3Q9NUN7 267 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 EXD2Q9NVH0 621 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 EMC3Q9P0I2 261 aa9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF716A6NP11 495 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 A8MV72 311 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 E7EQL1 145 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 M0R1B8 84 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 IFNA2P01563 188 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 OR12D1P0DN82 309 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 CCNA2P20248 432 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 RYKP34925 604 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 PGM1P36871 562 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 SERPINB5P36952 375 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 CLDN8P56748 225 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 MAPK14Q16539 360 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 FBXW9Q5XUX1 488 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 SLC22A25Q6T423 547 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 KLHL17Q6TDP4 642 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 P2RY8Q86VZ1 359 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 ANKRD46Q86W74 232 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 HIPK1Q86Z02 1210 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 XAGE5Q8WWM1 108 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 RAB8BQ92930 207 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 ARL5BQ96KC2 179 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 CBLN4Q9NTU7 201 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 PCDHGB4Q9UN71 923 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 WDR45Q9Y484 360 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 FREM1Q5H8C1 2179 aa9.11□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 FAM234BA2RU67 622 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 KIAA0513O60268 411 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 DNAJA2O60884 412 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 BPGMP07738 259 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 DHRS4L1P0CG22 281 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 CREB1P16220 341 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 CD40P25942 277 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 TTKP33981 857 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 FABP6P51161 128 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 OR2B6P58173 313 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 EMX2Q04743 252 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 IFFO1Q0D2I5 559 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 PDK3Q15120 406 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 GPAT3Q53EU6 434 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 C9orf135Q5VTT2 229 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 B3GLCTQ6Y288 498 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 SSX8Q7RTT4 187 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC103Q8IW40 242 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 PHC2Q8IXK0 858 aa9.1□□□□□ -0.95
CLRN3-201ENST00000368671 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms