RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ReckQ9Z0J1 971 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccl27Q9Z1X0 120 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Jbts17Q8CE72 3214 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpina3jD3Z451 420 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm43720E0CXM8 267 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdh19E9Q3A7 770 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ComtO88587 265 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Amd1P0DMN7 334 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NrtnP97463 195 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc30a10Q3UVU3 470 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mtmr11Q3V1L6 700 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LpoQ5SW46 710 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vdac3Q60931 283 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hat1Q8BY71 416 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q8C5S3 137 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxl8Q8CIG9 374 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Steap1Q9CWR7 339 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pfn3Q9DAD6 137 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NcdnQ9Z0E0 729 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm28961A0A087WPA5 222 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21858A0A087WQ24 222 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r90A0A087WR36 309 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1056A2AVY0 313 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Enthd1E9Q1Z2 618 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm9493F6SVV1 192 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nfkbil1O88995 381 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DbiP31786 87 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 S100a1P56565 94 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc2a9Q3T9X0 538 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm9881Q8BR56 211 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Poglut1Q8BYB9 392 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phf21bQ8C966 487 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rtn4rl1Q8K0S5 445 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SrrdQ8K2M3 249 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp810Q99K45 461 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gdpd1Q9CRY7 314 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam166aQ9D4K5 319 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 2200002D01RikQ9D809 114 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Srebf1Q9WTN3 1134 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AireQ9Z0E3 552 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Heatr5bQ8C547 2070 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm595A2AF73 655 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FkbplO35450 347 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01735 133 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Apoa2P09813 102 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sox9Q04887 507 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DmwdQ08274 665 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam71f1Q3UZD7 341 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EdnraQ61614 427 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr128Q7TRJ1 308 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc34a3Q80SU6 601 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pgr15lQ80T54 456 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trmt12Q8BG71 446 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Raf1Q99N57 648 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mfsd2aQ9DA75 534 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tssc4Q9JHE7 317 aa14.96□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r105E9Q3A5 860 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dscr3O35075 297 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fcn1O70165 334 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc12a3P59158 1002 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sf3b6P59708 125 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acss3Q14DH7 682 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nxpe2Q3U095 558 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mansc4Q3UU94 337 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cxcl17Q5UW37 119 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DmknQ6P253 517 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Marveld1Q7TQJ1 173 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 JamlQ80UL9 379 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Glrx5Q80Y14 152 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C1qtnf7Q8BVD7 289 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc1a7Q8JZR4 559 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cables2Q8K3M5 476 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adam26aQ9R158 697 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm14085A2AWR5 660 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gabrb1P50571 474 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm648Q3UJ22 213 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sez6Q7TSK2 991 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Otop1Q80VM9 600 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mab21l2Q8BPP1 359 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arfrp1Q8BXL7 201 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r85Q8VIB8 308 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam118aQ91YN1 357 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam69aQ9D6I7 428 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adat1Q9JHI2 499 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mpeg1A1L314 713 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scgb2b3D2XZ38 112 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp97E9PZP6 546 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr730E9Q8M3 318 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp960L7N267 546 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcp2P12660 120 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpina3mQ03734 418 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem248Q3TBN1 314 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sohlh1Q6IUP1 357 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rcc2Q8BK67 520 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plekho2Q8K124 495 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhdc8aQ91XA8 350 aa14.95□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SelenosQ9BCZ4 190 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.2 ms