Protein–RNA interactions for Protein: P09813

Apoa2, Apolipoprotein A-II, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa2P09813 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,11■■■□□ 2,89
Apoa2P09813 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Apoa2P09813 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Apoa2P09813 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Apoa2P09813 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Apoa2P09813 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Apoa2P09813 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Apoa2P09813 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,58■■■□□ 2,33
Apoa2P09813 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Apoa2P09813 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Apoa2P09813 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Apoa2P09813 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Apoa2P09813 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
Apoa2P09813 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Apoa2P09813 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Apoa2P09813 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Apoa2P09813 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Apoa2P09813 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Apoa2P09813 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Apoa2P09813 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Apoa2P09813 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Apoa2P09813 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Apoa2P09813 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Apoa2P09813 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Apoa2P09813 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Apoa2P09813 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Apoa2P09813 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Apoa2P09813 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Apoa2P09813 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Apoa2P09813 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Apoa2P09813 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Apoa2P09813 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Apoa2P09813 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Apoa2P09813 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Apoa2P09813 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Apoa2P09813 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Apoa2P09813 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Apoa2P09813 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Apoa2P09813 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Apoa2P09813 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Apoa2P09813 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Apoa2P09813 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Apoa2P09813 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Apoa2P09813 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Apoa2P09813 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Apoa2P09813 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Apoa2P09813 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Apoa2P09813 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Apoa2P09813 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Apoa2P09813 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Apoa2P09813 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Apoa2P09813 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Apoa2P09813 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Apoa2P09813 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,51■■□□□ 1,83
Apoa2P09813 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Apoa2P09813 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Apoa2P09813 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Apoa2P09813 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Apoa2P09813 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Apoa2P09813 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Apoa2P09813 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,33■■□□□ 1,8
Apoa2P09813 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Apoa2P09813 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Apoa2P09813 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Apoa2P09813 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Apoa2P09813 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Apoa2P09813 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Apoa2P09813 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Apoa2P09813 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Apoa2P09813 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Apoa2P09813 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Apoa2P09813 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Apoa2P09813 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Apoa2P09813 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Apoa2P09813 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Apoa2P09813 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Apoa2P09813 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Apoa2P09813 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Apoa2P09813 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Apoa2P09813 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Apoa2P09813 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Apoa2P09813 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Apoa2P09813 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Apoa2P09813 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Apoa2P09813 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Apoa2P09813 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Apoa2P09813 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Apoa2P09813 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Apoa2P09813 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Apoa2P09813 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Apoa2P09813 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Apoa2P09813 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Apoa2P09813 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Apoa2P09813 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Apoa2P09813 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Apoa2P09813 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Apoa2P09813 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Apoa2P09813 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Apoa2P09813 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Apoa2P09813 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,6 ms