Protein–RNA interactions for Protein: O70165

Fcn1, Ficolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcn1O70165 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fcn1O70165 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Fcn1O70165 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fcn1O70165 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fcn1O70165 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Fcn1O70165 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fcn1O70165 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fcn1O70165 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fcn1O70165 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fcn1O70165 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fcn1O70165 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fcn1O70165 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fcn1O70165 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fcn1O70165 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fcn1O70165 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fcn1O70165 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Fcn1O70165 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Fcn1O70165 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fcn1O70165 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fcn1O70165 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fcn1O70165 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Fcn1O70165 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fcn1O70165 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fcn1O70165 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fcn1O70165 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fcn1O70165 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fcn1O70165 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fcn1O70165 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fcn1O70165 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fcn1O70165 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fcn1O70165 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Fcn1O70165 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fcn1O70165 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fcn1O70165 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fcn1O70165 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fcn1O70165 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fcn1O70165 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fcn1O70165 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fcn1O70165 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fcn1O70165 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fcn1O70165 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fcn1O70165 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Fcn1O70165 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fcn1O70165 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fcn1O70165 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fcn1O70165 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fcn1O70165 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fcn1O70165 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fcn1O70165 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fcn1O70165 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fcn1O70165 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fcn1O70165 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Fcn1O70165 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fcn1O70165 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fcn1O70165 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fcn1O70165 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fcn1O70165 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fcn1O70165 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fcn1O70165 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fcn1O70165 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fcn1O70165 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fcn1O70165 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fcn1O70165 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fcn1O70165 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fcn1O70165 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fcn1O70165 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fcn1O70165 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fcn1O70165 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fcn1O70165 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fcn1O70165 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fcn1O70165 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fcn1O70165 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fcn1O70165 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fcn1O70165 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fcn1O70165 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fcn1O70165 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fcn1O70165 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fcn1O70165 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fcn1O70165 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fcn1O70165 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fcn1O70165 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fcn1O70165 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fcn1O70165 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fcn1O70165 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fcn1O70165 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fcn1O70165 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fcn1O70165 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fcn1O70165 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fcn1O70165 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fcn1O70165 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fcn1O70165 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fcn1O70165 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fcn1O70165 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fcn1O70165 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fcn1O70165 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fcn1O70165 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fcn1O70165 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fcn1O70165 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fcn1O70165 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fcn1O70165 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms