Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gabrb1P50571 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Gabrb1P50571 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gabrb1P50571 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gabrb1P50571 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Gabrb1P50571 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gabrb1P50571 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gabrb1P50571 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gabrb1P50571 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gabrb1P50571 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gabrb1P50571 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gabrb1P50571 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gabrb1P50571 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gabrb1P50571 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Gabrb1P50571 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gabrb1P50571 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gabrb1P50571 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gabrb1P50571 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Gabrb1P50571 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gabrb1P50571 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gabrb1P50571 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gabrb1P50571 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Gabrb1P50571 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gabrb1P50571 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gabrb1P50571 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gabrb1P50571 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gabrb1P50571 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gabrb1P50571 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gabrb1P50571 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gabrb1P50571 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Gabrb1P50571 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gabrb1P50571 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gabrb1P50571 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gabrb1P50571 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gabrb1P50571 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gabrb1P50571 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gabrb1P50571 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gabrb1P50571 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gabrb1P50571 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gabrb1P50571 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gabrb1P50571 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gabrb1P50571 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gabrb1P50571 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gabrb1P50571 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gabrb1P50571 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gabrb1P50571 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gabrb1P50571 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gabrb1P50571 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gabrb1P50571 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gabrb1P50571 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gabrb1P50571 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gabrb1P50571 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gabrb1P50571 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gabrb1P50571 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gabrb1P50571 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gabrb1P50571 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gabrb1P50571 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gabrb1P50571 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gabrb1P50571 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gabrb1P50571 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gabrb1P50571 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Gabrb1P50571 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gabrb1P50571 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gabrb1P50571 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gabrb1P50571 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gabrb1P50571 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gabrb1P50571 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gabrb1P50571 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gabrb1P50571 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gabrb1P50571 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gabrb1P50571 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gabrb1P50571 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gabrb1P50571 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gabrb1P50571 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabrb1P50571 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabrb1P50571 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabrb1P50571 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gabrb1P50571 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gabrb1P50571 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gabrb1P50571 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gabrb1P50571 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gabrb1P50571 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gabrb1P50571 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gabrb1P50571 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabrb1P50571 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gabrb1P50571 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gabrb1P50571 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gabrb1P50571 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabrb1P50571 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabrb1P50571 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabrb1P50571 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabrb1P50571 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabrb1P50571 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabrb1P50571 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabrb1P50571 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabrb1P50571 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabrb1P50571 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabrb1P50571 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabrb1P50571 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabrb1P50571 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms