Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Gdpd1Q9CRY7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Gdpd1Q9CRY7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Gdpd1Q9CRY7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Gdpd1Q9CRY7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
Gdpd1Q9CRY7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Gdpd1Q9CRY7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Gdpd1Q9CRY7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Gdpd1Q9CRY7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Gdpd1Q9CRY7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Gdpd1Q9CRY7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Gdpd1Q9CRY7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Gdpd1Q9CRY7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Gdpd1Q9CRY7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Gdpd1Q9CRY7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Gdpd1Q9CRY7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Gdpd1Q9CRY7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Gdpd1Q9CRY7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Gdpd1Q9CRY7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Gdpd1Q9CRY7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Gdpd1Q9CRY7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Gdpd1Q9CRY7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Gdpd1Q9CRY7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Gdpd1Q9CRY7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
Gdpd1Q9CRY7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Gdpd1Q9CRY7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Gdpd1Q9CRY7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Gdpd1Q9CRY7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Gdpd1Q9CRY7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Gdpd1Q9CRY7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Gdpd1Q9CRY7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Gdpd1Q9CRY7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Gdpd1Q9CRY7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Gdpd1Q9CRY7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Gdpd1Q9CRY7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Gdpd1Q9CRY7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Gdpd1Q9CRY7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Gdpd1Q9CRY7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Gdpd1Q9CRY7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Gdpd1Q9CRY7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Gdpd1Q9CRY7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Gdpd1Q9CRY7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Gdpd1Q9CRY7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Gdpd1Q9CRY7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Gdpd1Q9CRY7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Gdpd1Q9CRY7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Gdpd1Q9CRY7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Gdpd1Q9CRY7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Gdpd1Q9CRY7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Gdpd1Q9CRY7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Gdpd1Q9CRY7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Gdpd1Q9CRY7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Gdpd1Q9CRY7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Gdpd1Q9CRY7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gdpd1Q9CRY7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Gdpd1Q9CRY7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Gdpd1Q9CRY7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Gdpd1Q9CRY7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Gdpd1Q9CRY7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gdpd1Q9CRY7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gdpd1Q9CRY7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Gdpd1Q9CRY7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gdpd1Q9CRY7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gdpd1Q9CRY7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gdpd1Q9CRY7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gdpd1Q9CRY7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gdpd1Q9CRY7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Gdpd1Q9CRY7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gdpd1Q9CRY7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gdpd1Q9CRY7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Gdpd1Q9CRY7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gdpd1Q9CRY7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gdpd1Q9CRY7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gdpd1Q9CRY7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gdpd1Q9CRY7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gdpd1Q9CRY7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Gdpd1Q9CRY7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Gdpd1Q9CRY7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Gdpd1Q9CRY7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Gdpd1Q9CRY7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Gdpd1Q9CRY7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Gdpd1Q9CRY7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Gdpd1Q9CRY7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Gdpd1Q9CRY7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Gdpd1Q9CRY7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Gdpd1Q9CRY7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Gdpd1Q9CRY7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Gdpd1Q9CRY7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gdpd1Q9CRY7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Gdpd1Q9CRY7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Gdpd1Q9CRY7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Gdpd1Q9CRY7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Gdpd1Q9CRY7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Gdpd1Q9CRY7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Gdpd1Q9CRY7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Gdpd1Q9CRY7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Gdpd1Q9CRY7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Gdpd1Q9CRY7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,56■■□□□ 1,52
Gdpd1Q9CRY7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Gdpd1Q9CRY7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
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