RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDCA4Q9BXL8 241 aa26.62■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PADI1Q9ULC6 663 aa26.62■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF318Q5VUA4 2279 aa26.6■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC22A8Q8TCC7 542 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 TTC9Q92623 222 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC187A0A096LP49 1063 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-208ENST00000573600 P2RX1P51575 399 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 BTBD16Q32M84 506 aa26.59■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-208ENST00000573600 COX6A1P12074 109 aa26.58■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KLHL22Q53GT1 634 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR51A7Q8NH64 312 aa26.58■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-208ENST00000573600 IMMP1LQ96LU5 166 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFT27Q9BW83 186 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 FN3KQ9H479 309 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 COG8Q96MW5 612 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 FUNDC2Q9BWH2 189 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOR4AQ9NXH8 423 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 NCDNQ9UBB6 729 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF337Q9Y3M9 751 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa26.56■■□□□ 1.84
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