RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520348.5

SNHG6-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG6, Length 648 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG6-201ENST00000520348 C17orf51A8MQB3 221 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 B4DXG7 233 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SCO2O43819 266 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 XPNPEP2O43895 674 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ITGA10O75578 1167 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SERPINA7P05543 415 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ATP6V1B1P15313 513 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 MSX1P28360 303 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OTX2P32243 289 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 DLSTP36957 453 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SOX3P41225 446 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SLC9A3P48764 834 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PCYT1AP49585 367 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 GABREP78334 506 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 Q0VFX4 171 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SNTA1Q13424 505 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OCLNQ16625 522 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PGGHGQ32M88 737 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 RAB43Q86YS6 212 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OR52D1Q9H346 318 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 RASSF1Q9NS23 344 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 MED17Q9NVC6 651 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 AASSQ9UDR5 926 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SPEGQ15772 3267 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 BHLHE40O14503 412 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 HCN1O60741 890 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SLC15A1P46059 708 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CCR4P51679 360 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 NADK2Q4G0N4 442 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 BORAQ6PGQ7 559 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CASP12Q6UXS9 341 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 P3H2Q8IVL5 708 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CDK20Q8IZL9 346 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 IQCF1Q8N6M8 205 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OR10G3Q8NGC4 313 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 FANK1Q8TC84 345 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ST8SIA1Q92185 356 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SGCDQ92629 289 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 NKD1Q969G9 470 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SGTBQ96EQ0 304 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 IP6K3Q96PC2 410 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TSSK6Q9BXA6 273 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SCN3BQ9NY72 215 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 M0R129 80 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SLC30A4O14863 429 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 MAN1A2O60476 641 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 NPIPB7O75200 414 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 RCBTB2O95199 551 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TSPAN19P0C672 248 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TACR3P29371 465 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 GRK5P34947 590 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SSR4P51571 173 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 EGR4Q05215 589 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 QPRTQ15274 297 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 GRINAQ7Z429 371 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SPARTQ8N0X7 666 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 LNX2Q8N448 690 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 FADS6Q8N9I5 356 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ELOA3Q8NG57 546 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OR2T33Q8NG76 320 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 DUSP19Q8WTR2 217 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 UBQLN3Q9H347 655 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms